运用454焦磷酸测序技术对病原菌16S-rDNA的分析

检验医学 ›› 2011, Vol. 26 ›› Issue (06): 364-367.

运用454焦磷酸测序技术对病原菌16S-rDNA的分析

周与华;郭晓奎;林萍;李擎天

上海交通大学医学院病原生物学教研室,上海,200025;上海交通大学医学院附属精神卫生中心检验科,上海,200030;上海交通大学医学院检验系,上海,200025

收稿日期:2011-06-01 出版日期:2011-06-01 发布日期:2011-06-01
通讯作者: 林萍

Application of 454 pyrosequencing analysis for 16S-rDNA of pathogen bacterium

ZHOU Yuhua;GUO Xiaokui;LIN Ping;LI Qingtian

Received:2011-06-01 Online:2011-06-01 Published:2011-06-01

摘要/Abstract

摘要： 目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值.方法运用聚合酶链反应(PCR)扩增及454焦磷酸测序技术,对标本中病原菌16S- rDNA V3区进行多样性分析;并与细菌培养结果相比较.结果测序能检测出临床不宜培养的菌属,如支原体属、嗜血杆菌属、莫拉菌属等;9种菌属为2种方法共同检测所得,7种菌属的P值均<0.05.结论 2种方法的检测敏感性差异有统计学意义;与细菌培养相结合是临床实践中的一种新的偿试.

中图分类号:

R446.5

周与华;郭晓奎;林萍;李擎天. 运用454焦磷酸测序技术对病原菌16S-rDNA的分析[J]. 检验医学, 2011, 26(06): 364-367.

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