青岛地区肾综合征出血热病毒基因分型

检验医学 ›› 2011, Vol. 26 ›› Issue (08): 523-526.

青岛地区肾综合征出血热病毒基因分型

程茂玲;乔刚

胶南市人民医院,山东,胶南,266400

收稿日期:2011-08-01 出版日期:2011-08-01 发布日期:2011-08-01
通讯作者: 程茂玲

Analysis of the genotyping of hantavirus in Qingdao

CHENG Maoling;QIAO Gang

Received:2011-08-01 Online:2011-08-01 Published:2011-08-01

摘要/Abstract

摘要： 目的调查青岛地区肾综合征出血热病毒的流行情况,研究病毒在该地区的分子流行病学特征及基因分型.方法采集64例肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清标本,提取血清中病毒RNA作为模板.根据GenBank中汉坦病毒基因序列,设计HTN型和SEO型的通用外套引物,同时分别设计HTN型特异性引物和SEO型的特异性引物作为内套引物.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增汉坦病毒基因组M片段G1区基因序列并测序.测序结果利用DNA Star软件进行核苷酸序列分析.结果在64例标本中用HTN型特异性引物扩增阳性6例,占9%;用SEO型特异性引物扩增阳性25例,占39%;总阳性率为48%.总体来看,青岛地区流行的汉坦病毒以SEO型为主.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,在核苷酸序列水平其基因的离散度为0.3%～8.9%.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散度为2.6%～11.2%.结论青岛地区汉坦病毒的流行以SEO型为主,HTN型并存,其中HTN型主要发生在胶南市.

关键词: 汉坦病毒, HTN型, SEO型, M区基因, 基因分型

中图分类号:

R373.9

程茂玲;乔刚. 青岛地区肾综合征出血热病毒基因分型[J]. 检验医学, 2011, 26(08): 523-526.

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