多重实时PCR直接检测反复性尿路感染患者中段尿样本碳青霉烯酶基因的临床价值

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2025.04.015

检验医学 ›› 2025, Vol. 40 ›› Issue (4): 400-403.DOI: 10.3969/j.issn.1673-8640.2025.04.015

多重实时PCR直接检测反复性尿路感染患者中段尿样本碳青霉烯酶基因的临床价值

黄声雷¹, 梅俊华², 周春妹¹, 马艳¹, 叶小燕¹, 王蓓丽¹, 潘柏申¹, 郭玮¹()

1.复旦大学附属中山医院检验科，上海 200032
2.复旦大学附属中山医院闵行医院检验科，上海 201100

收稿日期:2023-11-05 修回日期:2024-02-13 出版日期:2025-04-30 发布日期:2025-05-08
通讯作者: 郭玮，E-mail：Guo.wei@zs-hospital.sh.cn。
作者简介:黄声雷，男，1978年生，硕士，副主任技师，主要从事细菌耐药机制研究。
基金资助:
上海市科学技术委员会应急科技攻关基金项目(20411950500);白求恩基金中青年医生优才培养计划项目(BCF-SY-0311-20190807-07);病原微生物生物安全国家重点实验室开放基金项目(SKLPBS2144)

Received:2023-11-05 Revised:2024-02-13 Online:2025-04-30 Published:2025-05-08

摘要/Abstract

摘要：

目的探讨多重实时聚合酶链反应（PCR）快速检测反复性尿路感染患者中段尿样本5种碳青霉烯酶耐药基因的临床价值。方法收集2021年1月—2022年12月复旦大学附属中山医院2个院区反复性尿路感染患者中段尿样本590例，采用多重实时PCR方法直接检测尿液中碳青霉烯酶耐药基因（blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaVIM和blaOXA-48）。对中段尿样本进行病原菌培养和体外药物敏感性试验，并采用PCR确认培养结果为碳青霉烯类耐药革兰阴性杆菌的5种碳青霉烯酶型。结果 590例样本中，多重实时PCR检出其中54例（9.15%）样本中存在60个碳青霉烯酶耐药基因，敏感性和特异性分别为100.00%和93.71%，阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）分别为33.33%和100.00%。直接进行PCR检测的结果与基于培养的PCR结果比较，一致性较好（Kappa值为0.937）。结论与常规培养比较，多重实时PCR是一种快速且具有高敏感性、高特异性和较高阴性预测值的方法，可用于直接检测反复性尿路感染患者中段尿样本碳青霉烯酶耐药基因。

关键词: 中段尿, 多重实时聚合酶链反应, 碳青霉烯酶, 耐药基因, 快速检测

中图分类号:

R446.1

黄声雷, 梅俊华, 周春妹, 马艳, 叶小燕, 王蓓丽, 潘柏申, 郭玮. 多重实时PCR直接检测反复性尿路感染患者中段尿样本碳青霉烯酶基因的临床价值[J]. 检验医学, 2025, 40(4): 400-403.

图/表 3

参考文献 17

[1]	SHEU C C, CHANG Y T, LIN S Y, et al. Infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae:an update on therapeutic options[J]. Front Microbiol, 2019, 10:80.
[2]	World Health Organization. Global priority list of antibiotic-resistant bacteria to guide research,discovery,and development of new antibiotics[EB/OL]. (2017-02-25)[2022-12-25]. https://www.aidsdatahub.org/sites/default/files/resource/who-global-priority-list-antibiotic-resistant-bacteria.
[3]	喻华, 徐雪松, 李敏, 等. 肠杆菌目细菌碳青霉烯酶的实验室检测和临床报告规范专家共识(第二版)[J]. 中国感染与化疗杂志, 2022, 22(4):463-474. DOI
[4]	LI H H, HE Z J, XIE L M, et al. Evaluation of Xpert Carba-R assay for the detection of carbapenemase genes in gram-negative bacteria[J]. Biomed Res Int, 2021, 2021:6614812.
[5]	JIN S, LEE J Y, PARK J Y, et al. Xpert Carba-R assay for detection of carbapenemase-producing organisms in patients admitted to emergency rooms[J]. Medicine(Baltimore), 2020, 99(50):e23410.
[6]	徐旋, 曲芬. 碳青霉烯耐药的肠杆菌科细菌诊断进展[J]. 生物工程学报, 2018, 34(8):1338-1345.
[7]	张凡, 李耘, 甘露, 等. 北京市2016—2017年耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学和遗传特征调查[J]. 中国抗生素杂志, 2020, 45(6):610-620.
[8]	BASSETTI M, VENA A, GIACOBBE D R, et al. Management of infections caused by multidrug-resistant gram-negative pathogens:recent advances and future directions[J]. Arch Med Res, 2021, 52(8):817-827.
[9]	BAI Y, HAO Y, SHAO C, et al. Accuracy of Xpert Carba-R assay for the diagnosis of carbapenemase-producing organisms from rectal swabs and clinical isolates:a meta-analysis of diagnostic studies[J]. J Mol Diagn, 2021, 23(11):1534-1544.
[10]	CAI Z, TAO J, JIA T, et al. Multicenter evaluation of the Xpert Carba-R assay for detection and identification of carbapenemase genes in sputum specimens[J]. J Clin Microbiol, 2020, 58(9):e00644-20.
[11]	CORTEGIANI A, RUSSOTTO V, GRAZIANO G, et al. Use of cepheid Xpert Carba-R for rapid detection of carbapenemase-producing bacteria in abdominal septic patients admitted to intensive care unit[J]. PLoS One, 2016, 11(8):e0160643.
[12]	COINTE A, WALEWSKI V, HOBSON C A, et al. Rapid carbapenemase detection with Xpert Carba-R V2 directly on positive blood vials[J]. Infect Drug Resist, 2019, 12:3311-3316. DOI PMID
[13]	全国细菌耐药监测网. 全国细菌耐药监测网2014—2019年尿标本细菌耐药监测报告[J]. 中国感染控制杂志, 2021, 20(1):52-59.
[14]	全国细菌耐药监测网. 全国细菌耐药监测网2014—2019年细菌耐药性监测报告[J]. 中国感染控制杂志, 2021, 20(1):15-30.
[15]	BYUN J H, KIM Y A, KIM M, et al. Evaluation of Xpert Carba-R assay v.2 to detect carbapenemase genes in two hospitals in Korea[J]. Ann Lab Med, 2020, 40(3):209-215. DOI PMID
[16]	HOYOS-MALLECOT Y, OUZANI S, DORTET L, et al. Performance of the Xpert^® Carba-R v2 in the daily workflow of a hygiene unit in a country with a low prevalence of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae[J]. Int J Antimicrob Agents, 2017, 49(6):774-777.
[17]	TERZI H A, AYDEMIR O, KILIC U, et al. Comparison of the Xpert CARBA-R Test and phenotypical tests for detection of carbapenemases types in multidrug resistant K. pneumoniae isolates[J]. Clin Lab, 2019, 65(8).

病原菌	菌株数/[株（%）]	CRO/[株（%）]	碳青霉烯酶耐药基因
病原菌	菌株数/[株（%）]	CRO/[株（%）]	blaKCP/株	blaNDM/株	blaIMP/株	blaVIM/株
革兰阴性杆菌	137（40.4）	16（100.0）	8	5	3	2
大肠埃希菌	70（20.6）	2（12.5）	0	2	0	0
肺炎克雷伯菌	19（5.6）	9（56.3）	8	1	0	0
奇异变形杆菌	19（5.6）	0（0.0）	0	0	0	0
弗劳地枸橼酸杆菌	6（1.8）	0（0.0）	0	0	0	0
摩根摩根菌	5（1.5）	0（0.0）	0	0	0	0
阴沟肠杆菌	5（1.5）	2（12.5）	0	0	2	0
铜绿假单胞菌	4（1.2）	0（0.0）	0	0	0	0
嗜麦芽窄食单胞菌	3（0.9）
产吲哚金黄杆菌	3（0.9）	2（12.5）	0	2	0	1
其他非发酵菌①	3（0.9）	1（6.3）	0	0	1	1
革兰阳性球菌	27（8.0）
屎肠球菌	14（4.1）
粪肠球菌	13（3.8）
念珠菌	11（3.2）

病原菌	菌株数/[株（%）]	CRO/[株（%）]	碳青霉烯酶耐药基因
病原菌	菌株数/[株（%）]	CRO/[株（%）]	blaKCP/株	blaNDM/株	blaIMP/株	blaVIM/株
革兰阴性杆菌	137（40.4）	16（100.0）	8	5	3	2
大肠埃希菌	70（20.6）	2（12.5）	0	2	0	0
肺炎克雷伯菌	19（5.6）	9（56.3）	8	1	0	0
奇异变形杆菌	19（5.6）	0（0.0）	0	0	0	0
弗劳地枸橼酸杆菌	6（1.8）	0（0.0）	0	0	0	0
摩根摩根菌	5（1.5）	0（0.0）	0	0	0	0
阴沟肠杆菌	5（1.5）	2（12.5）	0	0	2	0
铜绿假单胞菌	4（1.2）	0（0.0）	0	0	0	0
嗜麦芽窄食单胞菌	3（0.9）
产吲哚金黄杆菌	3（0.9）	2（12.5）	0	2	0	1
其他非发酵菌①	3（0.9）	1（6.3）	0	0	1	1
革兰阳性球菌	27（8.0）
屎肠球菌	14（4.1）
粪肠球菌	13（3.8）
念珠菌	11（3.2）

Xpert Carba-R检测结果	常规培养结果		合计
Xpert Carba-R检测结果	阳性	阴性	合计
总体
阳性	18	36	54
阴性	0	536	536
合计	18	572	590
blaKCP
阳性	8	7	15
阴性	0	575	575
合计	8	582	590
blaNDM
阳性	5	28	33
阴性	0	557	557
合计	5	585	590
blaIMP
阳性	3	4	7
阴性	0	583	583
合计	3	587	590
blaVIM
阳性	2	3	5
阴性	0	585	585
合计	2	588	590

Xpert Carba-R检测结果	常规培养结果		合计
Xpert Carba-R检测结果	阳性	阴性	合计
总体
阳性	18	36	54
阴性	0	536	536
合计	18	572	590
blaKCP
阳性	8	7	15
阴性	0	575	575
合计	8	582	590
blaNDM
阳性	5	28	33
阴性	0	557	557
合计	5	585	590
blaIMP
阳性	3	4	7
阴性	0	583	583
合计	3	587	590
blaVIM
阳性	2	3	5
阴性	0	585	585
合计	2	588	590

多重实时PCR直接检测反复性尿路感染患者中段尿样本碳青霉烯酶基因的临床价值

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

图/表 3

参考文献 17

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

耐药基因	敏感性/ %	特异性/ %	PPV/ %	NPV/ %	Kappa值
总体	100.00	93.71	33.33	100.00	0.937
blaKPC	100.00	98.79	53.33	100.00	0.988
blaNDM	100.00	95.21	15.15	100.00	0.952
blaIMP	100.00	99.31	42.86	100.00	0.993
blaVIM	100.00	99.49	40.00	100.00	0.995

[1]	郭超楠, 王妍妍, 张贝, 庞敬莹, 崔非非, 赵永新, 苏兵. 不同类型临床样本来源肺炎克雷伯菌耐药性和毒力分析[J]. 检验医学, 2024, 39(9): 880-887.
[2]	吴泉明, 陈发林, 陈丽清, 陈东杰, 黄建刚, 陈喜军, 何鑫. 铜绿假单胞菌碳青霉烯类抗菌药物单纯耐药机制分析[J]. 检验医学, 2024, 39(12): 1234-1236.
[3]	朱昱蓉, 张丹, 贺雅星, 李晶晶, 黄晶, 李婷, 刘鹏, 刘荣华. 肺炎克雷伯菌临床分离株分子分群和流行病学特征[J]. 检验医学, 2023, 38(5): 435-440.
[4]	方咏梅, 章燕, 徐雪莹, 钟峰. 金黄色葡萄球菌耐药性与耐药基因和毒力基因的相关性[J]. 检验医学, 2023, 38(4): 357-361.
[5]	王佳玮, 朱威南, 陈颖盈, 季萍, 王颖. 血培养分离碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌临床分布和耐药基因分析[J]. 检验医学, 2023, 38(4): 362-367.
[6]	杨思敏, 轩乾坤, 羽晓瑜, 温冬华, 李广波. 国产某品牌大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌及3种碳青霉烯耐药基因试剂性能验证[J]. 检验医学, 2023, 38(1): 56-59.
[7]	王诗淇, 李荷楠, 刘井波, 王占伟, 王知任, 迟大利, 王辉. 环介导等温扩增技术快速检测粪便样本艰难拟梭菌的临床应用[J]. 检验医学, 2022, 37(9): 860-863.
[8]	孙英, 李轶, 闫文娟, 荆楠, 马冰. 河南地区少见CRE耐药性分析及碳青霉烯酶初筛实验的临床应用[J]. 检验医学, 2022, 37(2): 146-149.
[9]	王芳, 邓燕燕, 林见敏, 王金金, 龚倩, 黄声雷. 改良碳青霉烯灭活试验和碳青霉烯酶抑制剂增强试验鉴定肠杆菌目细菌产碳青霉烯酶型别的临床价值[J]. 检验医学, 2022, 37(12): 1183-1186.
[10]	宋皓月, 舒文. 肉芽肿性乳腺炎患者结核硬脂酸棒状杆菌毒力因子和耐药性分析[J]. 检验医学, 2022, 37(11): 1075-1078.
[11]	姚锂凤, 郑巧平, 杨蒙, 罗清琼, 陈旭, 陈福祥. 胶体金免疫层析法快速检测CRE碳青霉烯酶效果评价[J]. 检验医学, 2022, 37(1): 68-71.
[12]	张冠怡, 姚冬婷, 王健, 胡晓波. 光滑念珠菌耐药机制及中西药治疗光滑念珠菌感染研究进展[J]. 检验医学, 2021, 36(7): 761-765.
[13]	侯伟伟, 江涟, 李冬. MALDI-TOF MS直接鉴定血培养阳性病原的临床应用[J]. 检验医学, 2021, 36(4): 424-429.
[14]	尹娟, 王莹超, 眭阳, 江春, 时蕴琦, 朱超望. mCIM与eCIM在产碳青霉烯酶肠杆菌科细菌表型筛查中的价值[J]. 检验医学, 2021, 36(2): 177-180.
[15]	陆书华, 李晓哲, 刘凌云, 金呈强, 戈宁宁, 董海新. 山东某院耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌临床感染特征及耐药基因分析[J]. 检验医学, 2020, 35(8): 757-762.