环介导等温扩增技术快速检测粪便样本艰难拟梭菌的临床应用

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2022.09.013

检验医学 ›› 2022, Vol. 37 ›› Issue (9): 860-863.DOI: 10.3969/j.issn.1673-8640.2022.09.013

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环介导等温扩增技术快速检测粪便样本艰难拟梭菌的临床应用

王诗淇¹, 李荷楠¹(), 刘井波¹, 王占伟¹, 王知任¹, 迟大利², 王辉¹

1.北京大学人民医院检验科,北京 100044
2.复星诊断科技（上海）有限公司参考检测中心,上海 200444

收稿日期:2021-10-16 修回日期:2022-06-18 出版日期:2022-09-30 发布日期:2022-10-25
通讯作者: 李荷楠
作者简介:李荷楠,E-mail： lhnpku@163.com。
王诗淇,女,1983年生,学士,主管检验师,主要从事微生物学检验技术研究。
基金资助:
国家科技重大专项(2018ZX10732401-003-016)

Application evaluation of loop-mediated isothermal amplification in determining Clostridioides difficile in fecal samples

WANG Shiqi¹, LI Henan¹(), LIU Jingbo¹, WANG Zhanwei¹, WANG Zhiren¹, CHI Dali², WANG Hui¹

1. Department of Clinical Laboratory,Peking University People's Hospital,Beijing 100044,China
2. Reference Testing Center,Fosun Diagnostics（Shanghai） Co. Ltd.,Shanghai 200444,China

Received:2021-10-16 Revised:2022-06-18 Online:2022-09-30 Published:2022-10-25
Contact: LI Henan

摘要/Abstract

摘要：

目的评价环介导等温扩增技术（LAMP）快速检测粪便样本中艰难拟梭菌的临床应用价值。方法收集132例临床送检粪便样本,分别采用LAMP法、培养法、艰难拟梭菌毒素法进行检测,比较3种方法检测艰难拟梭菌的一致性;以培养法为标准,评价LAMP法检测艰难拟梭菌的灵敏度和特异性。结果 AMP法检测艰难拟梭菌的灵敏度为10⁵CFU/mL;LAMP法艰难拟梭菌检出率（13.64%）高于培养法（11.11%,χ²=18.74,P<0.05）和艰难拟梭菌毒素法（9.09%,χ²=35.94,P<0.05）。培养法检测出的11种细菌和2种真菌,LAMP法检测结果均为阴性。结论与培养法和艰难拟梭菌毒素法相比,LAMP法具有特异性强,反应时间短等优势,且无交叉反应,在艰难拟梭菌快速检测中具有一定的价值。

关键词: 艰难拟梭菌, 环介导等温扩增技术, 快速检测

Abstract:

Objective To evaluate a loop-mediated isothermal amplification（LAMP） for the rapid determination of Clostridioides difficile in fecal samples from patients. Methods Totally,132 clinical fecal samples were collected and determined by LAMP,bacterium culture and toxin Clostridioides difficile assay,respectively. The consistency of the 3 methods was evaluated. The specificity and sensitivity were evaluated. Results The sensitivity of LAMP for determing Clostridioides difficile reached 10⁵ CFU/mL. The positive rate of LAMP（13.64%） was higher than that of bacterium culture（11.11%,χ²=18.74,P<0.05） and that of toxin Clostridioides difficile assay（9.09%,χ²=35.94,P<0.05）. The LAMP showed all negative for the 11 bacteria and 2 fungi determined by bacterium culture. Conclusions Compared with bacterium culture and toxin Clostridioides difficile assay,the LAMP surpasses in good specificity and short reaction time. It can be regarded as a rapid determination method for Clostridioides difficile.

Key words: Clostridioides difficile, Loop-mediated isothermal amplification, Rapid determination

中图分类号:

R378.8

王诗淇, 李荷楠, 刘井波, 王占伟, 王知任, 迟大利, 王辉. 环介导等温扩增技术快速检测粪便样本艰难拟梭菌的临床应用[J]. 检验医学, 2022, 37(9): 860-863.

WANG Shiqi, LI Henan, LIU Jingbo, WANG Zhanwei, WANG Zhiren, CHI Dali, WANG Hui. Application evaluation of loop-mediated isothermal amplification in determining Clostridioides difficile in fecal samples[J]. Laboratory Medicine, 2022, 37(9): 860-863.

图/表 4

参考文献 14

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菌株名称	细菌培养法检出菌株数/株	LAMP法Ct值
大肠埃希菌	12	11.5~26.0
屎肠球菌	12	13.0~26.0
热带念珠菌	8	16.5~24.0
肺炎克雷伯菌	7	11.5~24.0
肠炎沙门菌	1	12.5
弗劳地枸橼酸杆菌	1	13.5
鸟肠球菌	1	17.5
粪肠球菌	1	18.0
胶黏罗斯菌	1	19.0
芽孢杆菌属	1	22.5
白念珠菌	1	22.5
阴沟肠杆菌	1	24.0
鲍曼不动杆菌	1	>30.0

菌株名称	细菌培养法检出菌株数/株	LAMP法Ct值
大肠埃希菌	12	11.5~26.0
屎肠球菌	12	13.0~26.0
热带念珠菌	8	16.5~24.0
肺炎克雷伯菌	7	11.5~24.0
肠炎沙门菌	1	12.5
弗劳地枸橼酸杆菌	1	13.5
鸟肠球菌	1	17.5
粪肠球菌	1	18.0
胶黏罗斯菌	1	19.0
芽孢杆菌属	1	22.5
白念珠菌	1	22.5
阴沟肠杆菌	1	24.0
鲍曼不动杆菌	1	>30.0

细菌培养法	LAMP法		合计
细菌培养法	阳性	阴性	合计
阳性	7	4	11
阴性	10	78	88

细菌培养法	LAMP法		合计
细菌培养法	阳性	阴性	合计
阳性	7	4	11
阴性	10	78	88

艰难拟梭菌毒素法	LAMP法		合计
艰难拟梭菌毒素法	阳性	阴性	合计
阳性	6	4	10
弱阳性	4	4	8
阴性	4	88	92

环介导等温扩增技术快速检测粪便样本艰难拟梭菌的临床应用

Application evaluation of loop-mediated isothermal amplification in determining Clostridioides difficile in fecal samples

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