Ⅰ类整合子对铜绿假单胞菌亚胺培南耐药诊断价值的Meta分析

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2016.06.011

摘要/Abstract

摘要：

目的通过Meta分析探讨Ⅰ类整合子与铜绿假单胞菌亚胺培南耐药的相关性,以及Ⅰ类整合子检测在诊断铜绿假单胞菌亚胺培南耐药中的临床价值。方法通过计算机检索中国生物医学文献数据库（CBM）、中国知网（CNKI）、万方数据库、维普数据库（VIP）以及英文PubMed、Embase数据库,检索国内外关于Ⅰ类整合子与铜绿假单胞菌亚胺培南耐药相关性的文献,检索时间均为建库至2015年12月,按纳入、排除标准由2位人员独立进行文献筛选、资料提取和质量评价,采用RevMan 5.2和Meta-Disc 1.4软件进行Meta分析。结果符合纳入标准的文献共24篇,包含2 101株临床分离的铜绿假单胞菌,其中Ⅰ类整合子阳性1 134株（54.0%）,亚胺培南耐药929株（44.2%）。Meta分析结果显示,Ⅰ类整合子在铜绿假单胞菌亚胺培南耐药株中的检出率明显高于敏感株[比值比（OR）为4.82,95%可信区间（CI）为2.68~8.66];Ⅰ类整合子检测诊断铜绿假单胞菌亚胺培南耐药的合并敏感性、特异性、阳性似然比、阴性似然比分别为0.73（95%CI为0.70~0.76）、0.64（95%CI为0.61~0.66）、1.90（95%CI为1.47~2.45）、0.47（95%CI为0.35~0.64）,拟合综合受试者工作特征（SROC）曲线下面积（AUC）为0.749 5。结论 Ⅰ类整合子与铜绿假单胞菌亚胺培南耐药相关,Ⅰ类整合子检测对诊断铜绿假单胞菌亚胺培南耐药具有一定价值,建议临床将Ⅰ类整合子检测与其他方法联合使用,以提高其检验效能。

关键词: Ⅰ类整合子, 铜绿假单胞菌, 亚胺培南耐药, 诊断, Meta分析

Abstract:

Objective To analyze the correlation between Class Ⅰ integron and imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa through Meta-analysis,and evaluate Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. Methods The databases,including Chinese Biomedical Literature Database（CBM）,China National Knowledge Infrastructure（CNKI）,WANFANG,Chinese VIP Database（VIP）,PubMed and Embase,were searched from establishment to December 2015 for Class Ⅰ integron,imipenem resistance and Pseudomonas aeruginosa. Datum selection,extraction and assessment were conducted by 2 reviewers independently according to inclusion and exclusion criteria. Meta-analysis was performed by RevMan 5.2 and Meta-Disc 1.4. Results A total of 24 papers were in accordance with inclusion criteria,which included 2 101 isolates of Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical specimens. Among them,1 134 isolates （54.0%） were positive for Class Ⅰ integron,while 929 isolates （44.2%） were resistant to imipenem. Meta-analysis showed that Class Ⅰ integron was more common in imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa than in imipenem-sensitive Pseudomonas aeruginosa [odds ratio（OR） was 4.82,95% confidence interval（CI） was 2.68-8.66]. In the determination of Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa,the sensitivity,specificity,positive likelihood ratio and negative likelihood ratio were 0.73（95%CI was 0.70-0.76）,0.64（95%CI was 0.61-0.66）,1.90（95%CIwas 1.47-2.45） and 0.47（95%CI was 0.35-0.64）,respectively,and the area under summary receiver operating characteristic（SROC） curve（AUC） was 0.749 5. Conclusions Class Ⅰ integron is related to imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. The determination of Class Ⅰ integron has certain significance in diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. It is suggested to be combined with other clinical methods to improve efficiency.

Key words: Class Ⅰ integron, Pseudomonas aeruginosa, Imipenem resistance, Diagnosis, Meta-analysis

中图分类号:

R446.5

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图/表 6

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作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	亚胺培南耐药株(%)		亚胺培南敏感株(%)
作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	整合子+	整合子-	整合子+	整合子-
Severino 2002	巴西	1997至1998	重症监护病房	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	NCCLS 1998	—	85	30（35）	12（14）	24（28）	19（22）
Fonseca 2005	巴西	2000至2003	—	—	梅里埃鉴定系统	—	—	—	106	22（21）	13（12）	22（21）	49（46）
Gu 2007	中国江苏	2003至2005	多科室	—	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	98	35（36）	10（10）	5（5）	48（49）
张霖 2007	中国浙江	2005至2006	重症监护病房	痰液	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	33	0（0）	12（36）	0（0）	21（64）
武渊 2008	中国江苏	1997至2003	多科室	痰液、血液、脓液、尿液、导管、口腔分泌物、气管套管	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	—	ATCC 27853	47	27（57）	2（4）	2（4）	16（34）
Chen 2009	中国浙江	2006至2007	—	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSL 2006	—	71	7（10）	14（20）	20（28）	30（42）
Yousefi 2010	伊朗	2007至2008	多科室	痰液、血液、导管、脑脊液、胸水、伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	ATCC 27853	160	61（38）	6（4）	29（18）	64（40）
张春芳 2010	中国江苏	2009	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	NCCLS	—	50	9（18）	15（40）	0（0）	26（52）
张桔红 2010	中国广东	2007至2008	多科室	痰液、创面、大便、咽拭子、腹水	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	60	23（38）	7（12）	12（20）	18（30）
李翔 2011	中国湖南	2007	多科室	痰液、分泌物、血液、胸水	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2006	ATCC 27853	42	6（14）	13（31）	15（36）	8（19）
杜艳 2011	中国云南	2011	多科室	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2008	ATCC 27853	111	69（62）	12（11）	8（7）	22（20）
Moradian 2012	伊朗	2011至2012	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	54	17（31）	13（24）	3（6）	21（39）
李春红 2012	中国山东	2008至2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、引流液、肺泡灌洗液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	56	17（30）	2（4）	26（46）	11（20）
孙静静 2012	中国广东	2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、血液	BD Phoenix 鉴定系统	纸片扩散法	—	ATCC 27853 ATCC 25922	234	36（15）	11（5）	82（35）	105（45）
王玉巧 2012	中国宁夏	2009	门诊	—	MicroScan Walkway鉴定系统	琼脂对倍稀释法	CLSI 2005	—	57	4（7）	4（7）	26（46）	23（40）
Nikokar 2012	伊朗	2010至2011	烧伤科	伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2008	ATCC 27853	39	16（41）	8（21）	11（28）	4（10）
毕嘉琦 2013	中国广东	2008至2012	多科室	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	348	67（19）	45（13）	105（30）	131（38）
Rajabnia 2013	伊朗	2008至2009	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2011	—	81	15（19）	1（1）	15（19）	50（62）
黄娟 2013	中国广东	2011至2012	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 27853	81	15（19）	1（0）	15（19）	50（62）
朱桂芳 2013	中国江苏	2011	—	痰液、尿液、血液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 25922 ATCC 25923	60	2（3）	1（2）	19（32）	38（63）
苏维奇 2013	中国山东	2009至2011	—	—	MicroScan Walkway鉴定系统	NC31试验板	—	ATCC 27853	200	98（49）	22（11）	17（8）	63（32）
Kiddee 2013	泰国	2007至2008	—	痰液、脓液、尿液、血液、伤口分泌物等	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2007	—	50	37（74）	9（18）	4（8）	0（0）
Garza 2015	墨西哥	2004至2011	—	—	—	琼脂平皿稀释法	CLSI 2012	ATCC	45	38（84）	5（11）	2（4）	0（0）
多丽波 2015	中国黑龙江	2011至2012	—	痰液、尿液、分泌物、血液	MicroScan Walkway鉴定系统	组合纸片法	—	—	62	16（26）	24（39）	5（8）	17（27）

作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	亚胺培南耐药株(%)		亚胺培南敏感株(%)
作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	整合子+	整合子-	整合子+	整合子-
Severino 2002	巴西	1997至1998	重症监护病房	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	NCCLS 1998	—	85	30（35）	12（14）	24（28）	19（22）
Fonseca 2005	巴西	2000至2003	—	—	梅里埃鉴定系统	—	—	—	106	22（21）	13（12）	22（21）	49（46）
Gu 2007	中国江苏	2003至2005	多科室	—	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	98	35（36）	10（10）	5（5）	48（49）
张霖 2007	中国浙江	2005至2006	重症监护病房	痰液	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	33	0（0）	12（36）	0（0）	21（64）
武渊 2008	中国江苏	1997至2003	多科室	痰液、血液、脓液、尿液、导管、口腔分泌物、气管套管	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	—	ATCC 27853	47	27（57）	2（4）	2（4）	16（34）
Chen 2009	中国浙江	2006至2007	—	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSL 2006	—	71	7（10）	14（20）	20（28）	30（42）
Yousefi 2010	伊朗	2007至2008	多科室	痰液、血液、导管、脑脊液、胸水、伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	ATCC 27853	160	61（38）	6（4）	29（18）	64（40）
张春芳 2010	中国江苏	2009	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	NCCLS	—	50	9（18）	15（40）	0（0）	26（52）
张桔红 2010	中国广东	2007至2008	多科室	痰液、创面、大便、咽拭子、腹水	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	60	23（38）	7（12）	12（20）	18（30）
李翔 2011	中国湖南	2007	多科室	痰液、分泌物、血液、胸水	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2006	ATCC 27853	42	6（14）	13（31）	15（36）	8（19）
杜艳 2011	中国云南	2011	多科室	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2008	ATCC 27853	111	69（62）	12（11）	8（7）	22（20）
Moradian 2012	伊朗	2011至2012	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	54	17（31）	13（24）	3（6）	21（39）
李春红 2012	中国山东	2008至2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、引流液、肺泡灌洗液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	56	17（30）	2（4）	26（46）	11（20）
孙静静 2012	中国广东	2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、血液	BD Phoenix 鉴定系统	纸片扩散法	—	ATCC 27853 ATCC 25922	234	36（15）	11（5）	82（35）	105（45）
王玉巧 2012	中国宁夏	2009	门诊	—	MicroScan Walkway鉴定系统	琼脂对倍稀释法	CLSI 2005	—	57	4（7）	4（7）	26（46）	23（40）
Nikokar 2012	伊朗	2010至2011	烧伤科	伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2008	ATCC 27853	39	16（41）	8（21）	11（28）	4（10）
毕嘉琦 2013	中国广东	2008至2012	多科室	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	348	67（19）	45（13）	105（30）	131（38）
Rajabnia 2013	伊朗	2008至2009	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2011	—	81	15（19）	1（1）	15（19）	50（62）
黄娟 2013	中国广东	2011至2012	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 27853	81	15（19）	1（0）	15（19）	50（62）
朱桂芳 2013	中国江苏	2011	—	痰液、尿液、血液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 25922 ATCC 25923	60	2（3）	1（2）	19（32）	38（63）
苏维奇 2013	中国山东	2009至2011	—	—	MicroScan Walkway鉴定系统	NC31试验板	—	ATCC 27853	200	98（49）	22（11）	17（8）	63（32）
Kiddee 2013	泰国	2007至2008	—	痰液、脓液、尿液、血液、伤口分泌物等	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2007	—	50	37（74）	9（18）	4（8）	0（0）
Garza 2015	墨西哥	2004至2011	—	—	—	琼脂平皿稀释法	CLSI 2012	ATCC	45	38（84）	5（11）	2（4）	0（0）
多丽波 2015	中国黑龙江	2011至2012	—	痰液、尿液、分泌物、血液	MicroScan Walkway鉴定系统	组合纸片法	—	—	62	16（26）	24（39）	5（8）	17（27）

组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）	组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）
研究地区					样本采集时间
国外	8	4.31	1.65~11.24	77	2005年前	4	10.74	2.25~51.16	87
国内	16	5.13	2.41~10.91	85	2005年后	20	4.01	2.09~7.70	83
样本采集科室					细菌鉴定方法
重症监护病房	4	3.90	1.48~10.26	43	仪器	18	4.65	2.43~8.89	85
其他	20	4.95	2.54~9.64	85	手工	5	5.5	1.22~24.78	81
样本来源					药物敏感性试验
仪器设备	2	6.99	2.45~19.95	0	琼脂平皿稀释法	10	5.83	1.61~21.09	87
人体相关	22	4.67	2.48~8.77	85	纸片法	8	3.06	1.31~7.14	74
样本量					药物敏感性卡	5	7.21	2.52~20.67	81
>100株	6	7.18	2.92~17.69	89	质控菌株
<100株	18	4.03	1.76~9.22	80	无	10	3.79	1.65~8.72	75
					有	14	5.75	2.49~13.28	87

组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）	组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）
研究地区					样本采集时间
国外	8	4.31	1.65~11.24	77	2005年前	4	10.74	2.25~51.16	87
国内	16	5.13	2.41~10.91	85	2005年后	20	4.01	2.09~7.70	83
样本采集科室					细菌鉴定方法
重症监护病房	4	3.90	1.48~10.26	43	仪器	18	4.65	2.43~8.89	85
其他	20	4.95	2.54~9.64	85	手工	5	5.5	1.22~24.78	81
样本来源					药物敏感性试验
仪器设备	2	6.99	2.45~19.95	0	琼脂平皿稀释法	10	5.83	1.61~21.09	87
人体相关	22	4.67	2.48~8.77	85	纸片法	8	3.06	1.31~7.14	74
样本量					药物敏感性卡	5	7.21	2.52~20.67	81
>100株	6	7.18	2.92~17.69	89	质控菌株
<100株	18	4.03	1.76~9.22	80	无	10	3.79	1.65~8.72	75
					有	14	5.75	2.49~13.28	87

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