致败血症、脑膜炎合并肺炎的14型猪链球菌病原学和分子特征分析

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2024.11.003

检验医学 ›› 2024, Vol. 39 ›› Issue (11): 1042-1047.DOI: 10.3969/j.issn.1673-8640.2024.11.003

致败血症、脑膜炎合并肺炎的14型猪链球菌病原学和分子特征分析

周宁¹, 毛敏¹, 纪昕¹, 何佳乐², 叶秀云¹, 林裕博¹, 钟伟¹, 刘洋³()

1.南方科技大学医院检验科，广东深圳 518055
2.南方科技大学医学院，广东深圳 518055
3.南方科技大学医院医学研究中心，广东深圳 518055

收稿日期:2023-11-10 修回日期:2024-04-03 出版日期:2024-11-30 发布日期:2024-11-29
通讯作者: 刘洋
作者简介:刘洋，E-mail：liuy7@sustech.edu.cn。
周宁，女，1988年生，硕士，主管技师，主要从事铜绿假单胞菌生物被膜致病机制研究。
基金资助:
广东省基础与应用基础研究面上项目(2024A1515013245);科技基础资源调查专项/华南地区感染病原敏感性与耐药性监测调研项目(2019FY101207);深圳市南山区卫生健康系统科技重大项目(NS2D2023064);深圳市南山区卫生科技项目(NS2021028)

Etiology and molecular analysis of Streptococcus suis type 14 causing sepsis, meningitis and pneumonia

ZHOU Ning¹, MAO Min¹, JI Xin¹, HE Jiale², YE Xiuyun¹, LIN Yubo¹, ZHONG Wei¹, LIU Yang³()

1. Department of Clinical Laboratory，Southern University of Science and Technology Hospital，Shenzhen 518055，Guangdong，China
2. Medical School，Southern University of Science and Technology，Shenzhen 518055，Guangdong，China
3. Medical Research Center，Southern University of Science and Technology Hospital，Shenzhen 518055，Guangdong，China

Received:2023-11-10 Revised:2024-04-03 Online:2024-11-30 Published:2024-11-29
Contact: LIU Yang

摘要/Abstract

摘要：

目的通过对患者血液标本中分离出的病原菌进行鉴定和分析，了解14型猪链球菌的病原学和分子特征。方法采用质谱分析和血清凝集试验进行菌种鉴定；采用微量肉汤稀释法分析临床分离菌株的耐药性。采用聚合酶链反应（PCR）检测临床分离菌株的7种主要毒力基因；用二代测序获得基因组信息，并进行平均核苷酸一致性（ANI）、ST分型、耐药基因分析。结果该临床分离菌株与14型猪链球菌诊断血清发生凝集反应，与2型猪链球菌诊断血清不发生凝集反应。PCR检测结果示16S rRNA阳性、cps2J阴性、cps14J阳性。分离菌株除对红霉素、阿奇霉素、四环素和克林霉素耐药外，对包括万古霉素在内的其他9种抗菌药物均敏感。除gapdh毒力基因阴性外，该菌株6个主要毒力基因mrp、fbps、sly、orf2、ef和gdh均为阳性；测序结果示该菌株为ST 1型，系统发育树分析结果示该菌株与前期深圳市和广西壮族自治区分离株具有密切的亲缘关系。结论分离的病原菌为高毒力株14型猪链球菌ST 1型，可导致患者同时并发败血症、脑膜炎和肺炎，目前尚未见相关报道。疫源地应加强疫情预防和监控，避免病例再次出现。

关键词: 14型猪链球菌, 鉴定, 毒力基因, 平均核苷酸一致性

Abstract:

Objective To identify and analyze the pathogenic bacteria isolated from blood samples of patients，and to understand the etiology and molecular characteristics of Streptococcus suis type 14. Methods Mass spectrometry analysis and serum agglutination test were used for identification. The drug resistance was analyzed by microbroth dilution method，and polymerase chain reaction （PCR）was used to determine 7 main virulence genes. Genomic information was obtained by next generation sequencing，and average nucleotide identity（ANI），ST typing and drug resistance gene analysis were performed. Results The isolates showed agglutination reaction with Streptococcus suis type 14，but no agglutination reaction with Streptococcus suis type 2. PCR showed positive 16S rRNA，negative cps2J and positive cps14J. The isolate were sensitive to all 9 antibiotics，including vancomycin，except for erythromycin，azithromycin，tetracycline and clindamycin，which were resistant. Except for gapdh virulence gene negative，the 6 main virulence genes，mrp，fbps，sly，orf2，ef and gdh，were all positive. The sequencing results showed ST 1 type，and phylogenetic tree analysis showed that this isolate had a relationship with previous isolates from Shenzhen City and Guangxi Zhuang Autonomous Region. Conclusions The isolated pathogen is highly virulent isolate Streptococcus suis type 14 ST 1，which can cause complications such as sepsis，meningitis and pneumonia in patients. Currently，there are no relevant reports. Epidemic prevention and monitoring should be strengthened in epidemic areas to avoid the recurrence of cases.

Key words: Streptococcus suis, Identification, Virulence gene, Average nucleotide identity

中图分类号:

R378.1

周宁, 毛敏, 纪昕, 何佳乐, 叶秀云, 林裕博, 钟伟, 刘洋. 致败血症、脑膜炎合并肺炎的14型猪链球菌病原学和分子特征分析[J]. 检验医学, 2024, 39(11): 1042-1047.

ZHOU Ning, MAO Min, JI Xin, HE Jiale, YE Xiuyun, LIN Yubo, ZHONG Wei, LIU Yang. Etiology and molecular analysis of Streptococcus suis type 14 causing sepsis, meningitis and pneumonia[J]. Laboratory Medicine, 2024, 39(11): 1042-1047.

图/表 6

参考文献 23

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引物名称	正向引物序列（5´~3´）	反向引物序列（5´~3´）	退火温度/℃	扩增产物大小/bp
16S rRNA	CAGTATTTACCGCATGGTAGATAT	GTAAGATACCGTCAAGTGAGAA	60	303
cps2J	GTTGAGTCCTTATACACCTGTT	CAGAAAATTCATATTGTCCACC	60	664
cps14J	TCTTATAACAGGCGTCAAAACA	ATCGGTATAAAAGCAAGACACA	56	128
gapdh	TGACAAGAAAGTAACTGCTGA	CAATGAACCGAATGAGA	48	123
mrp	GGTATACCTTGCTGGTACCGTTC	AGTCTCTACAGCTGTAGCTGG	60	510
fbps	TCGTCCTCAACATCCGCA	CATTGTCCAACTGACGAATCTCCTC	60	160
sly	AGTTCGCACTTGATTTTAAG	AATACATTGCCCAGATTACTC	60	1 060
orf2	CAAGTGTATGTGTGGATGGG	ATCCAGTTGACACGTGCA	56	830
ef	ACAAAGGCGTAGGTTCAATC	CGGCATCAAGAATGTCTTTG	56	251
gdh	GCAGCGTATTCTGTCAAACG	CCATGGACAGATAAAGATGG	56	664

引物名称	正向引物序列（5´~3´）	反向引物序列（5´~3´）	退火温度/℃	扩增产物大小/bp
16S rRNA	CAGTATTTACCGCATGGTAGATAT	GTAAGATACCGTCAAGTGAGAA	60	303
cps2J	GTTGAGTCCTTATACACCTGTT	CAGAAAATTCATATTGTCCACC	60	664
cps14J	TCTTATAACAGGCGTCAAAACA	ATCGGTATAAAAGCAAGACACA	56	128
gapdh	TGACAAGAAAGTAACTGCTGA	CAATGAACCGAATGAGA	48	123
mrp	GGTATACCTTGCTGGTACCGTTC	AGTCTCTACAGCTGTAGCTGG	60	510
fbps	TCGTCCTCAACATCCGCA	CATTGTCCAACTGACGAATCTCCTC	60	160
sly	AGTTCGCACTTGATTTTAAG	AATACATTGCCCAGATTACTC	60	1 060
orf2	CAAGTGTATGTGTGGATGGG	ATCCAGTTGACACGTGCA	56	830
ef	ACAAAGGCGTAGGTTCAATC	CGGCATCAAGAATGTCTTTG	56	251
gdh	GCAGCGTATTCTGTCAAACG	CCATGGACAGATAAAGATGG	56	664

致败血症、脑膜炎合并肺炎的14型猪链球菌病原学和分子特征分析

Etiology and molecular analysis of Streptococcus suis type 14 causing sepsis, meningitis and pneumonia

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抗菌药物	最低抑菌浓度/（μg·mL-1）	结果
青霉素	0.12	敏感
头孢吡肟	1	敏感
头孢噻肟	1	敏感
头孢曲松	1	敏感
利奈唑胺	2	敏感
万古霉素	1	敏感
红霉素	1	耐药
阿奇霉素	2	耐药
四环素	8	耐药
氯霉素	4	敏感
左氧氟沙星	2	敏感
克林霉素	1	耐药
奎奴普丁-达福普汀	1	敏感

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