γ干扰素基因多态性与鼻咽癌易感性的分析

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2018.06.005

检验医学 ›› 2018, Vol. 33 ›› Issue (6): 486-490.DOI: 10.3969/j.issn.1673-8640.2018.06.005

γ干扰素基因多态性与鼻咽癌易感性的分析

谢晴晴¹, 欧阳博慧¹, 李恩¹, 毕忠平¹, 朱胜波¹, 唐健¹, 孙一帆²

1. 广西中医药大学第三附属医院柳州市中医医院检验科,广西柳州 545001
2. 广西医科大学附属柳铁中心医院检验科,广西柳州 545007

收稿日期:2017-04-19 出版日期:2018-06-30 发布日期:2018-07-06
作者简介:null
作者简介：谢晴晴,女,1984年生,主管技师,主要从事分子生物学检验研究; 欧阳博慧,女,1984年生,主管技师,主要从事分子生物学检验研究; 谢晴晴与欧阳博慧对本研究具有同等贡献,并列为第一作者。

通信作者：孙一帆,联系电话：0772-8810486。
基金资助:
广西壮族自治区卫生和计划生育委员会自筹经费科研课题（Z2015206、Z2015207）;柳州市科学研究与技术开发课题（2015J030506）;广西中医药大学自然科学研究项目（YB14030）

Interferon gamma polymorphisms and the susceptibility to nasopharyngeal carcinoma

XIE Qingqing¹, OUYANG Bohui¹, LI En¹, BI Zhongping¹, ZHU Shengbo¹, TANG Jian¹, SUN Yifan²

1. Department of Clinical Laboratory,the Third Affiliated Hospital of Guangxi University of Chinese Medicine,Liuzhou Traditional Chinese Medical Hospital,Liuzhou 545001,Guangxi,China
2. Department of Clinical Laboratory,Liutie Central Hospital,Guangxi Medical University,Liuzhou 545007,Guangxi,China

Received:2017-04-19 Online:2018-06-30 Published:2018-07-06

摘要/Abstract

摘要：

目的探讨γ干扰素（IFN-γ）基因多态性位点rs2430561（+874T/A）和rs1861494（+2109A/G）与鼻咽癌（NPC）遗传易感性的关系。方法收集NPC患者150例和健康对照者150名,+874T/A位点采用聚合酶链反应（PCR）-序列特异引物技术（SSP）进行基因分型,+2109A/G位点采用PCR-限制性片段长度多态性方法（RFLP）进行基因分型。结果与AA基因型相比,rs2430561 +874T/A 位点TT基因型患病风险显著降低[比值比（OR）=0.132,95%可信区间（CI）=0.022~0.800,P=0.028]。rs1861494+2109A/G位点各基因模型比较,差异均无统计学意义（P>0.05）。结论 IFN-γ rs2430561 +874T/A 位点基因多态性与NPC遗传易感性相关联。

关键词: γ干扰素;, 鼻咽癌, 遗传易感性

Abstract:

Objective To investigate the association between interferon gamma（IFN-γ）polymorphisms [rs2430561（+874T/A） and rs1861494（+2109A/G）] and the susceptibility to nasopharyngeal carcinoma（NPC）. Methods A total of 150 NPC patients and 150 healthy subjects were enrolled. IFN-γ +874T/A and +2109A/G were determined by polymerase chain reaction（PCR）-sequence-specific primer（SSP） and PCR-restriction fragment length polymorphism（RFLP）,respectively. Results Compared with AA genotype,the risk of rs2430561 +874T/A TT genotype was decreased [odds ratio（OR）=0.132,95% confidence interval（CI） 0.022-0.800,P=0.028]. However,there was no statistical significance for rs1861494 +2109A/G（P>0.05）. Conclusions IFN-γ rs2430561 +874T/A polymorphisms are associated with the susceptibility to NPC.

Key words: Interferon gamma, Nasopharyngeal carcinoma, Genetic susceptibility

中图分类号:

R446.1

谢晴晴, 欧阳博慧, 李恩, 毕忠平, 朱胜波, 唐健, 孙一帆. γ干扰素基因多态性与鼻咽癌易感性的分析[J]. 检验医学, 2018, 33(6): 486-490.

XIE Qingqing, OUYANG Bohui, LI En, BI Zhongping, ZHU Shengbo, TANG Jian, SUN Yifan. Interferon gamma polymorphisms and the susceptibility to nasopharyngeal carcinoma[J]. Laboratory Medicine, 2018, 33(6): 486-490.

图/表 3

参考文献 16

[1]	SUN Y,LU Y,PEN Q,et al.Interferon gamma +874 T/A polymorphism increases the risk of cervical cancer:evidence from a meta-analysis[J]. Tumour Biol,2015,36(6):4555-4564.
[2]	WU Z,SUN Y,ZHU S,et al.Association of interferon gamma +874T/A polymorphism and leukemia risk:a meta-analysis[J]. Medicine(Baltimore),2016,95(12):e3129.
[3]	VON LINSINGEN R,BOMPEIXE E P,MAESTRI C A,et al.IFNG(+874 T/A) polymorphism and cervical intraepithelial neoplasia in Brazilian women[J]. J Interferon Cytokine Res,2009,29(5):285-288.
[4]	WANG N,LU Y M,WANG S Z,et al.Association of interferon-γ gene polymorphism and risk of cervical HPV infection[J]. Zhonghua Fu Chan Ke Za Zhi,2012,47(10):738-741.
[5]	杜卫萍. 干扰素-γ、白介素-10基因多态性和环境因素联合作用与食管癌关系的研究[D]. 泰安:泰山医学院,2010.
[6]	GE Y Z,WANG Y D,XU Z,et al.Lack of association between interferon gamma +874 T/A polymorphism and cancer risk:an updated meta-analysis[J]. Tumour Biol,2014,35(7):6405-6414.
[7]	陈永琴,金文君,戴梦璐. 慢性乙型肝炎患者IFN-γ、IL-10和CD19+水平检测与病毒载量的关系[J]. 检验医学,2013,28(4):315-317.
[8]	PRAVICA V,PERREY C,STEVENS A,et al.A single nucleotide polymorphism in the first intron of the human IFN-gamma gene:absolute correlation with a polymorphic CA microsatellite marker of high IFN-gamma production[J]. Human Immunol,2000,61(9):863-866.
[9]	TAKAMI K,TAKUWA N,OKAZAKI H,et al.Interferon-gamma inhibits hepatocyte growth factor-stimulated cell proliferation of human bronchial epithelial cells:upregulation of p27(kip1) cyclin-dependent kinase inhibitor[J]. Am J Respir Cell Mol Biol,2002,26(2):231-238.
[10]	SAXENA R,CHAWLA Y K,VERMA I,et al.IFN-γ(+874) and not TNF-α(-308) is associated with HBV-HCC risk in India[J]. Mol Cell Biochem,2014,385(1-2):297-307.
[11]	TEIXEIRA A C,MENDES C T Jr,MARANO L A,et al. Alleles and genotypes of polymorphisms of IL-18, TNF-α and IFN-γ are associated with a higher risk and severity of hepatocellular carcinoma(HCC) in Brazil[J]. Hum Immunol,2013,74(8):1024-1029.
[12]	蓝艳,唐秀生,武洁,等. 广西壮族及汉族人群干扰素γ基因遗传多态性的研究[J]. 北京医学,2009,31(2):93-96.
[13]	张平安,吴健民,李艳. 干扰素γ基因内含子1+874位点多态性与乙型肝炎病毒感染关系的研究[J]. 中华流行病学杂志,2006,27(1):41-43.
[14]	GAO Q J,LIU D W,ZHANG S Y,et al.Polymorphisms of some cytokines and chronic hepatitis B and C virus infection[J]. World J Gastroenterol,2009,15(44):5610-5619.
[15]	LIU M,CAO B,ZHANG H,et al.Association of interferon-gamma gene haplotype in the Chinese population with hepatitis B virus infection[J]. Immunogenetics,2006,58(11):859-864.
[16]	吴金明,孙慧,吴康为,等. IFN-γ基因多态性与HBV感染不同结局之间的关系[J]. 温州医学院学报,2008,38(3):241-244.

SNP位点	引物	引物序列（5'~3'）	限制性内切酶
+874T/A （rs2430561）	上游引物1	TTCTTACAACACAAATACAATACT
	上游引物2	TTCTTACAACACAAATACAATACA
	下游引物	TCCCATATAAACCTATAATATGCA
内参引物	上游引物	CTTCAACACCCCAGCCTAGTAC
内参引物	下游引物	CCTCAGGGCAGCGAGACC
+2109A/G （rs1861494）	上游引物	GAGAGGTAAGGTGAGAGAGAACC
+2109A/G （rs1861494）	下游引物	AGCAAAGAAGGTCTACAAACT	MspI

SNP位点	引物	引物序列（5'~3'）	限制性内切酶
+874T/A （rs2430561）	上游引物1	TTCTTACAACACAAATACAATACT
	上游引物2	TTCTTACAACACAAATACAATACA
	下游引物	TCCCATATAAACCTATAATATGCA
内参引物	上游引物	CTTCAACACCCCAGCCTAGTAC
内参引物	下游引物	CCTCAGGGCAGCGAGACC
+2109A/G （rs1861494）	上游引物	GAGAGGTAAGGTGAGAGAGAACC
+2109A/G （rs1861494）	下游引物	AGCAAAGAAGGTCTACAAACT	MspI

SNP位点	基因型	基因频率		病例组与对照组相比
SNP位点	基因型	病例组[例（%）]	对照组[例（%）]	OR（95%CI）	P值
+874
	AA	99（66.0）	101（67.3）
	TA	48（32.0）	41（27.3）	1.327（0.775~2.272）	0.536
	TT	3（2.0）	8（5.3）	0.132（0.022~0.800）	0.028
	A	246（82.0）	243（81.0）
	T	54（18.0）	57（19.0）	0.890（0.570~1.388）	0.879
+2109
	AA	94（62.7）	96（64.0）
	AG	52（34.6）	49（32.7）	1.221（0.723~2.062）	0.738
	GG	4（2.7）	5（3.3）	0.317（0.068~1.487）	0.364
	A	240（80.0）	241（80.3）
	G	60（20.0）	59（19.7）	0.942（0.612~1.451）	0.883

SNP位点	基因型	基因频率		病例组与对照组相比
SNP位点	基因型	病例组[例（%）]	对照组[例（%）]	OR（95%CI）	P值
+874
	AA	99（66.0）	101（67.3）
	TA	48（32.0）	41（27.3）	1.327（0.775~2.272）	0.536
	TT	3（2.0）	8（5.3）	0.132（0.022~0.800）	0.028
	A	246（82.0）	243（81.0）
	T	54（18.0）	57（19.0）	0.890（0.570~1.388）	0.879
+2109
	AA	94（62.7）	96（64.0）
	AG	52（34.6）	49（32.7）	1.221（0.723~2.062）	0.738
	GG	4（2.7）	5（3.3）	0.317（0.068~1.487）	0.364
	A	240（80.0）	241（80.3）
	G	60（20.0）	59（19.7）	0.942（0.612~1.451）	0.883

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Interferon gamma polymorphisms and the susceptibility to nasopharyngeal carcinoma

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[1]	潘国刚，罗斌，滕元姬，梁丽娜. 白细胞介素-18基因启动子多态性与鼻咽癌遗传易感性的研究[J]. 检验医学, 2013, 28(6): 457-461.
[2]	毛维玉;龚文胜;程锦娥;潘秋燕;张媛媛. 深圳市健康人群EB病毒VCA-IgA抗体水平的调查分析[J]. 检验医学, 2011, 26(05): 323-326.
[3]	黄玲莎;朱波;陈艳华;赵惠柳. 肿瘤标志物三项联合检测在鼻咽癌诊断中的意义探讨[J]. 检验医学, 2006, 21(05): 472-474.
[4]	蒋丽娜;马志红;陈英武;何建方. 鼻咽癌患者治疗前后测定血清血管内皮生长因子的意义[J]. 检验医学, 2006, 21(03): 262-264.