MicroflexTM MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌鉴定能力的比较

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2015.02.005

摘要/Abstract

摘要： 目的

比较Microflex^TM基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对肠杆菌科细菌的鉴定能力。

方法

采用Microflex^TM MALDI-TOF MS 和Vitek 2 Compact同时对545株肠杆菌科质控菌株和临床分离菌株进行鉴定,鉴定结果不一致者采用沙门菌血清凝集试验或细菌16S rDNA基因测序予以确证。

结果

Microflex^TM MALDI-TOF MS对545株细菌的种和属的鉴定率分别为97.1%、2.9%。Vitek 2 Compact对545株细菌的种、群、属的鉴定率分别为83.3%、13.9%和2.2%,鉴定错误率为0.2%,未鉴定率为0.4%。

结论

Microflex^TM MALDI-TOF MS对肠杆菌科细菌的鉴定符合率高于Vitek 2 Compact,且操作快速、简便,成本低,可用于临床肠杆菌科细菌的常规快速鉴定。

关键词: 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱, 肠杆菌科细菌, 鉴定

Abstract: Objective

To compare the identification abilities of Microflex^TM matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and Vitek 2 Compact automatic microbial analysis system (Vitek 2 Compact) for Enterobacteriaceae.

Methods

A total of 545 isolates of Enterobacteriaceae from a variety of clinical and quality control isolates were identified by Microflex^TM MALDI-TOF MS and Vitek 2 Compact. The isolates were confirmed by 16S rDNA gene sequencing, and Salmonella was identified by serum agglutination test, if the identification results of the 2 systems didn't match.

Results

The coincidence rates of 545 isolates of Enterobacteriaceae identified by Microflex^TM MALDI-TOF MS were 97.1% to the species level and 2.9% to the genus level,respectively. The coincidence rates of 545 isolates of Enterobacteriaceae identified by Vitek 2 Compact were 83.3%,13.9% and 2.2% to the species, group and genus levels, respectively. The false rate was 0.2%, and the un-identification rate was 0.4%.

Conclusions

The identification coincidence rate of Enterobacteriaceae by Microflex^TM MALDI-TOF MS is higher than that of Vitek 2 Compact. Using Microflex^TM MALDI-TOF MS to identify Enterobacteriaceae is fast,simple to operate and low-cost,and it can be used in routine rapid identification of Enterobacteriaceae in clinical microbiology laboratories.

Key words: Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, Enterobacteriaceae, Identification

中图分类号:

R446.5

刘瑛, 俞静, 陈峰, 刘婧娴, 李媛睿, 皇甫昱婵, 沈立松. Microflex^TM MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌鉴定能力的比较[J]. 检验医学, 2015, 30(2): 122-127.

LIU Ying, YU Jing, CHENG Feng, LIU Jingxian, LI Yuanrui, HUANGFU Yuchan, SHEN Lisong. Comparison on the identification abilities of Microflex^TM MALDI-TOF MS and Vitek 2 Compact automatic microbial analysis system for Enterobacteriaceae[J]. Laboratory Medicine, 2015, 30(2): 122-127.

图/表 4

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菌名	株数 (%)	Microflex^TM MALDI-TOF MS					Vitek 2 Compact
菌名	株数 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)
埃希菌属	181(33.2)	181(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	179(98.9)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	2(1.1)
大肠埃希菌	180	180	0	0	0	0	178	0	0	0	2
赫尔曼埃希菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
克雷伯菌属	159(29.2)	159(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	159(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
肺炎克雷伯菌	140	140	0	0	0	0	140	0	0	0	0
产酸克雷伯菌	17	17	0	0	0	0	17	0	0	0	0
臭鼻克雷伯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
鼻硬结克雷伯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
肠杆菌属	76(13.9)	70(92.1)	0(0.0)	6(7.9)	0(0.0)	0(0.0)	21(27.6)	54(71.1)	1(1.3)	0(0.0)	0(0.0)
阴沟肠杆菌	50	47	0	3	0	0	0	50	0	0	0
产气肠杆菌	11	11	0	0	0	0	11	0	0	0	0
阿氏肠杆菌	4	4	0	0	0	0	3	0	1	0	0
日沟维肠杆菌	3	3	0	0	0	0	3	0	0	0	0
坂崎肠杆菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
霍氏肠杆菌	2	1	0	1	0	0	0	2	0	0	0
路德维希肠杆菌	2	0	0	2	0	0	0	2	0	0	0
生癌肠杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
河生肠杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
变形杆菌属	34(6.2)	34(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	26(76.5)	8(23.5)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
奇异变形杆菌	26	26	0	0	0	0	26	0	0	0	0
普通变形杆菌	6	6	0	0	0	0	0	6	0	0	0
潘氏变形杆菌	2	2	0	0	0	0	0	2	0	0	0
沙雷氏菌属	19(3.5)	19(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	16(84.2)	3(15.8)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
黏质沙雷菌	16	16	0	0	0	0	16	0	0	0	0
液化沙雷菌	3	3	0	0	0	0	0	3	0	0	0
枸橼酸杆菌属	16(2.9)	16(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	15(93.8)	0(0.0)	1(6.2)	0(0.0)	0(0.0)
弗劳地枸橼酸杆菌	8	8	0	0	0	0	7	0	1	0	0
克氏枸橼酸杆菌	5	5	0	0	0	0	5	0	0	0	0
布氏枸橼酸杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
无丙二酸枸橼酸杆菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
沙门菌属	14(2.6)	4(21.4)	0(0.0)	10(78.6)	0(0.0)	0(0.0)	4(28.6)	10(71.4)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
甲型副伤寒沙门菌	2	0	0	2	0	0	2	0	0	0	0
伤寒沙门菌	1	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0
鼠伤寒沙门菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
猪霍乱沙门菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
肠炎沙门菌	2	2	0	0	0	0	0	2	0	0	0
肠炎沙门菌亚利桑那亚种	1	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0
其它沙门菌	6	0	0	6	0	0	0	6	0	0	0
摩根菌属	12(2.2)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
摩根摩根菌	12	12	0	0	0	0	12	0	0	0	0

菌名	株数 (%)	Microflex^TM MALDI-TOF MS					Vitek 2 Compact
菌名	株数 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)
埃希菌属	181(33.2)	181(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	179(98.9)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	2(1.1)
大肠埃希菌	180	180	0	0	0	0	178	0	0	0	2
赫尔曼埃希菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
克雷伯菌属	159(29.2)	159(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	159(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
肺炎克雷伯菌	140	140	0	0	0	0	140	0	0	0	0
产酸克雷伯菌	17	17	0	0	0	0	17	0	0	0	0
臭鼻克雷伯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
鼻硬结克雷伯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
肠杆菌属	76(13.9)	70(92.1)	0(0.0)	6(7.9)	0(0.0)	0(0.0)	21(27.6)	54(71.1)	1(1.3)	0(0.0)	0(0.0)
阴沟肠杆菌	50	47	0	3	0	0	0	50	0	0	0
产气肠杆菌	11	11	0	0	0	0	11	0	0	0	0
阿氏肠杆菌	4	4	0	0	0	0	3	0	1	0	0
日沟维肠杆菌	3	3	0	0	0	0	3	0	0	0	0
坂崎肠杆菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
霍氏肠杆菌	2	1	0	1	0	0	0	2	0	0	0
路德维希肠杆菌	2	0	0	2	0	0	0	2	0	0	0
生癌肠杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
河生肠杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
变形杆菌属	34(6.2)	34(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	26(76.5)	8(23.5)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
奇异变形杆菌	26	26	0	0	0	0	26	0	0	0	0
普通变形杆菌	6	6	0	0	0	0	0	6	0	0	0
潘氏变形杆菌	2	2	0	0	0	0	0	2	0	0	0
沙雷氏菌属	19(3.5)	19(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	16(84.2)	3(15.8)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
黏质沙雷菌	16	16	0	0	0	0	16	0	0	0	0
液化沙雷菌	3	3	0	0	0	0	0	3	0	0	0
枸橼酸杆菌属	16(2.9)	16(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	15(93.8)	0(0.0)	1(6.2)	0(0.0)	0(0.0)
弗劳地枸橼酸杆菌	8	8	0	0	0	0	7	0	1	0	0
克氏枸橼酸杆菌	5	5	0	0	0	0	5	0	0	0	0
布氏枸橼酸杆菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
无丙二酸枸橼酸杆菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
沙门菌属	14(2.6)	4(21.4)	0(0.0)	10(78.6)	0(0.0)	0(0.0)	4(28.6)	10(71.4)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
甲型副伤寒沙门菌	2	0	0	2	0	0	2	0	0	0	0
伤寒沙门菌	1	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0
鼠伤寒沙门菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
猪霍乱沙门菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
肠炎沙门菌	2	2	0	0	0	0	0	2	0	0	0
肠炎沙门菌亚利桑那亚种	1	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0
其它沙门菌	6	0	0	6	0	0	0	6	0	0	0
摩根菌属	12(2.2)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
摩根摩根菌	12	12	0	0	0	0	12	0	0	0	0

菌名	株数 (%)	Microflex^TM MALDI-TOF MS					Vitek 2 Compact
菌名	株数 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)
拉乌尔菌属	12(2.2)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	6(50.0)	0(0.0)	6(50.0)	0(0.0)	0(0.0)
解鸟氨酸拉乌尔菌	8	8	0	0	0	0	3	0	5	0	0
植生拉乌尔菌	4	4	0	0	0	0	3	0	1	0	0
泛菌属	7(1.3)	7(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	3(42.9)	0(0.0)	4(57.1)	0(0.0)	0(0.0)
聚团泛菌	5	5	0	0	0	0	3	0	2	0	0
分散泛菌	2	2	0	0	0	0	0	0	2	0	0
普罗威登斯菌属	6(1.1)	6(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	6(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
雷氏普罗威登斯菌	4	4	0	0	0	0	4	0	0	0	0
斯氏普罗威登斯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
产碱普罗威登斯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
莱克勒菌属	4(0.7)	4(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	3(75.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(25.0)	0(0.0)
非脱羧莱克勒菌	4	4	0	0	0	0	3	0	0	1	0
哈夫尼亚菌属	2(0.4)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
蜂房哈夫尼亚菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
耶尔森菌属	2(0.4)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(50.0)	1(50.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
小肠结肠耶尔森菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
假结核耶尔森菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
爱德华菌属	1(0.2)	1(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
迟缓爱德华菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
合计	545(100.0)	529(97.1)	0(0.0)	16(2.9)	0(0.0)	0(0.0)	454(83.3)	76(13.9)	12(2.2)	1(0.2)	2(0.4)

菌名	株数 (%)	Microflex^TM MALDI-TOF MS					Vitek 2 Compact
菌名	株数 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)	鉴定到种 (%)	鉴定到群 (%)	鉴定到属 (%)	鉴定错误 (%)	未鉴定出 (%)
拉乌尔菌属	12(2.2)	12(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	6(50.0)	0(0.0)	6(50.0)	0(0.0)	0(0.0)
解鸟氨酸拉乌尔菌	8	8	0	0	0	0	3	0	5	0	0
植生拉乌尔菌	4	4	0	0	0	0	3	0	1	0	0
泛菌属	7(1.3)	7(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	3(42.9)	0(0.0)	4(57.1)	0(0.0)	0(0.0)
聚团泛菌	5	5	0	0	0	0	3	0	2	0	0
分散泛菌	2	2	0	0	0	0	0	0	2	0	0
普罗威登斯菌属	6(1.1)	6(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	6(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
雷氏普罗威登斯菌	4	4	0	0	0	0	4	0	0	0	0
斯氏普罗威登斯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
产碱普罗威登斯菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
莱克勒菌属	4(0.7)	4(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	3(75.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(25.0)	0(0.0)
非脱羧莱克勒菌	4	4	0	0	0	0	3	0	0	1	0
哈夫尼亚菌属	2(0.4)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
蜂房哈夫尼亚菌	2	2	0	0	0	0	2	0	0	0	0
耶尔森菌属	2(0.4)	2(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(50.0)	1(50.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
小肠结肠耶尔森菌	1	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
假结核耶尔森菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
爱德华菌属	1(0.2)	1(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	1(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
迟缓爱德华菌	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0
合计	545(100.0)	529(97.1)	0(0.0)	16(2.9)	0(0.0)	0(0.0)	454(83.3)	76(13.9)	12(2.2)	1(0.2)	2(0.4)

鉴定结果	株数	Microflex^TM MALDI-TOF MS					Vitek 2 Compact
鉴定结果	株数	鉴定到种	鉴定到群	鉴定到属	鉴定错误	未鉴定出	鉴定到种	鉴定到群	鉴定到属	鉴定错误	未鉴定出
一致	454(83.3)	454(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	454(100.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)
不一致	91(16.7)	75(82.4)	0(0.0)	16(17.6)	0(0.0)	0(0.0)	0(0.0)	76(83.5)	12(13.2)	1(1.1)	2(2.2)