Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa：a Meta-analysis

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2016.06.011

Abstract

Abstract:

Objective To analyze the correlation between Class Ⅰ integron and imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa through Meta-analysis,and evaluate Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. Methods The databases,including Chinese Biomedical Literature Database（CBM）,China National Knowledge Infrastructure（CNKI）,WANFANG,Chinese VIP Database（VIP）,PubMed and Embase,were searched from establishment to December 2015 for Class Ⅰ integron,imipenem resistance and Pseudomonas aeruginosa. Datum selection,extraction and assessment were conducted by 2 reviewers independently according to inclusion and exclusion criteria. Meta-analysis was performed by RevMan 5.2 and Meta-Disc 1.4. Results A total of 24 papers were in accordance with inclusion criteria,which included 2 101 isolates of Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical specimens. Among them,1 134 isolates （54.0%） were positive for Class Ⅰ integron,while 929 isolates （44.2%） were resistant to imipenem. Meta-analysis showed that Class Ⅰ integron was more common in imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa than in imipenem-sensitive Pseudomonas aeruginosa [odds ratio（OR） was 4.82,95% confidence interval（CI） was 2.68-8.66]. In the determination of Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa,the sensitivity,specificity,positive likelihood ratio and negative likelihood ratio were 0.73（95%CI was 0.70-0.76）,0.64（95%CI was 0.61-0.66）,1.90（95%CIwas 1.47-2.45） and 0.47（95%CI was 0.35-0.64）,respectively,and the area under summary receiver operating characteristic（SROC） curve（AUC） was 0.749 5. Conclusions Class Ⅰ integron is related to imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. The determination of Class Ⅰ integron has certain significance in diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa. It is suggested to be combined with other clinical methods to improve efficiency.

Key words: Class Ⅰ integron, Pseudomonas aeruginosa, Imipenem resistance, Diagnosis, Meta-analysis

CLC Number:

R446.5

HUANG Qiulan, FAN Deping, GAO Shouxia, LIU Hongchou, XUE Nali, NI Yuxing. Class Ⅰ integron for diagnosing imipenem resistance of Pseudomonas aeruginosa：a Meta-analysis[J]. Laboratory Medicine, 2016, 31(6): 491-498.

Figures/Tables 6

References 13

[1]	李玮, 王凯亮, 熊祝嘉, 等. 353株铜绿假单胞菌的临床分布与耐药性分析[J]. 中国实验诊断学, 2015, 19(7): 1107-1109.
[2]	方毅, 赵付菊, 赵虎. 华东医院感染老年患者多重耐药和广泛耐药革兰阴性杆菌的耐药性分析[J]. 检验医学, 2015, 30(5): 474-477.
[3]	孙建芝, 封建凯, 李杰, 等. 医院内感染多重耐药铜绿假单胞菌耐药性[J]. 中国实验诊断学, 2013, 17(8): 1391-1393.
[4]	刘洋, 邓琼, 余阳, 等. 碳青霉烯类抗生素耐药铜绿假单胞菌的耐药机制及同源性分析[J]. 中华烧伤杂志, 2014, 30(1): 15-20.
[5]	杨菁菁, 艾郊曼, 胡云建, 等. 泛耐药铜绿假单胞菌对β内酰胺类抗生素的耐药机制研究[J]. 中国感染与化疗杂志, 2013, 13(1): 14-18.
[6]	祝亚文, 张春霞, 彭立. 2007-2011年铜绿假单胞菌医院感染分布及耐药性分析[J]. 中华医院感染学杂志, 2013, 23(21): 5321-5323.
[7]	CAVALCANTI FL, MIRONES CR, PAUCAR ER, et al.Mutational and acquired carbapenem resistance mechanisms in multidrug resistant Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Recife, Brazil[J]. Mem Inst Oswaldo Cruz, 2015, 110(8): 1003-1009.
[8]	STOKES HW, HALL RM.A novel of family of potentially mobile DNA elements encoding site-specific gene-integration functions: integrons[J]. Mol Microbiol, 1989, 3(12): 1669-1683.
[9]	HALL RM, BROOKES DE, STOKES HW.Site-specific insertion of genes into integrons: role of the 59-base element and determination of the recombination cross-over point[J]. Mol Microbiol, 1991, 5(8): 1941-1959.
[10]	SHIMIZU W, KAYAMA S, KOUDA S, et al.Persistence and epidemic propagation of a Pseudomonas aeruginosa sequence type 235 clone harboring an IS26 composite transposon carrying the blaIMP-1 integron in Hiroshima, Japan, 2005 to 2012[J]. Antimicrob Agents Chemother, 2015, 59(5): 2678-2687.
[11]	VO AT,VAN DUIJKEREN E,FLUIT AC,et al.Class 1 integrons in Dutch Salmonella enterica serovar Dublin isolates from clinical cases of bovine salmonellosis[J]. Vet Microbiol, 2006, 117(2-4): 192-200.
[12]	多丽波, 李桂玲, 陈淑娟, 等. 铜绿假单胞菌金属酶及整合酶的检测[J]. 现代检验医学杂志, 2015, 30(1): 34-38.
[13]	朱桂芳, 章震花, 常月琴, 等. 临床分离铜绿假单胞菌整合子检测及分析[J]. 国际检验医学杂志, 2013, 34(16): 2068-2069.

作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	亚胺培南耐药株(%)		亚胺培南敏感株(%)
作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	整合子+	整合子-	整合子+	整合子-
Severino 2002	巴西	1997至1998	重症监护病房	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	NCCLS 1998	—	85	30（35）	12（14）	24（28）	19（22）
Fonseca 2005	巴西	2000至2003	—	—	梅里埃鉴定系统	—	—	—	106	22（21）	13（12）	22（21）	49（46）
Gu 2007	中国江苏	2003至2005	多科室	—	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	98	35（36）	10（10）	5（5）	48（49）
张霖 2007	中国浙江	2005至2006	重症监护病房	痰液	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	33	0（0）	12（36）	0（0）	21（64）
武渊 2008	中国江苏	1997至2003	多科室	痰液、血液、脓液、尿液、导管、口腔分泌物、气管套管	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	—	ATCC 27853	47	27（57）	2（4）	2（4）	16（34）
Chen 2009	中国浙江	2006至2007	—	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSL 2006	—	71	7（10）	14（20）	20（28）	30（42）
Yousefi 2010	伊朗	2007至2008	多科室	痰液、血液、导管、脑脊液、胸水、伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	ATCC 27853	160	61（38）	6（4）	29（18）	64（40）
张春芳 2010	中国江苏	2009	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	NCCLS	—	50	9（18）	15（40）	0（0）	26（52）
张桔红 2010	中国广东	2007至2008	多科室	痰液、创面、大便、咽拭子、腹水	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	60	23（38）	7（12）	12（20）	18（30）
李翔 2011	中国湖南	2007	多科室	痰液、分泌物、血液、胸水	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2006	ATCC 27853	42	6（14）	13（31）	15（36）	8（19）
杜艳 2011	中国云南	2011	多科室	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2008	ATCC 27853	111	69（62）	12（11）	8（7）	22（20）
Moradian 2012	伊朗	2011至2012	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	54	17（31）	13（24）	3（6）	21（39）
李春红 2012	中国山东	2008至2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、引流液、肺泡灌洗液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	56	17（30）	2（4）	26（46）	11（20）
孙静静 2012	中国广东	2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、血液	BD Phoenix 鉴定系统	纸片扩散法	—	ATCC 27853 ATCC 25922	234	36（15）	11（5）	82（35）	105（45）
王玉巧 2012	中国宁夏	2009	门诊	—	MicroScan Walkway鉴定系统	琼脂对倍稀释法	CLSI 2005	—	57	4（7）	4（7）	26（46）	23（40）
Nikokar 2012	伊朗	2010至2011	烧伤科	伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2008	ATCC 27853	39	16（41）	8（21）	11（28）	4（10）
毕嘉琦 2013	中国广东	2008至2012	多科室	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	348	67（19）	45（13）	105（30）	131（38）
Rajabnia 2013	伊朗	2008至2009	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2011	—	81	15（19）	1（1）	15（19）	50（62）
黄娟 2013	中国广东	2011至2012	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 27853	81	15（19）	1（0）	15（19）	50（62）
朱桂芳 2013	中国江苏	2011	—	痰液、尿液、血液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 25922 ATCC 25923	60	2（3）	1（2）	19（32）	38（63）
苏维奇 2013	中国山东	2009至2011	—	—	MicroScan Walkway鉴定系统	NC31试验板	—	ATCC 27853	200	98（49）	22（11）	17（8）	63（32）
Kiddee 2013	泰国	2007至2008	—	痰液、脓液、尿液、血液、伤口分泌物等	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2007	—	50	37（74）	9（18）	4（8）	0（0）
Garza 2015	墨西哥	2004至2011	—	—	—	琼脂平皿稀释法	CLSI 2012	ATCC	45	38（84）	5（11）	2（4）	0（0）
多丽波 2015	中国黑龙江	2011至2012	—	痰液、尿液、分泌物、血液	MicroScan Walkway鉴定系统	组合纸片法	—	—	62	16（26）	24（39）	5（8）	17（27）

作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	亚胺培南耐药株(%)		亚胺培南敏感株(%)
作者及时间(年)	研究地区	研究时间（年）	样本来源	样本种类	菌株鉴定系统	亚胺培南药物敏感性试验	药物敏感性判定标准	质控菌株	株数	整合子+	整合子-	整合子+	整合子-
Severino 2002	巴西	1997至1998	重症监护病房	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	NCCLS 1998	—	85	30（35）	12（14）	24（28）	19（22）
Fonseca 2005	巴西	2000至2003	—	—	梅里埃鉴定系统	—	—	—	106	22（21）	13（12）	22（21）	49（46）
Gu 2007	中国江苏	2003至2005	多科室	—	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	98	35（36）	10（10）	5（5）	48（49）
张霖 2007	中国浙江	2005至2006	重症监护病房	痰液	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	33	0（0）	12（36）	0（0）	21（64）
武渊 2008	中国江苏	1997至2003	多科室	痰液、血液、脓液、尿液、导管、口腔分泌物、气管套管	梅里埃鉴定系统	琼脂平皿稀释法	—	ATCC 27853	47	27（57）	2（4）	2（4）	16（34）
Chen 2009	中国浙江	2006至2007	—	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSL 2006	—	71	7（10）	14（20）	20（28）	30（42）
Yousefi 2010	伊朗	2007至2008	多科室	痰液、血液、导管、脑脊液、胸水、伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	ATCC 27853	160	61（38）	6（4）	29（18）	64（40）
张春芳 2010	中国江苏	2009	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	NCCLS	—	50	9（18）	15（40）	0（0）	26（52）
张桔红 2010	中国广东	2007至2008	多科室	痰液、创面、大便、咽拭子、腹水	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2005	ATCC 25922 ATCC 27853	60	23（38）	7（12）	12（20）	18（30）
李翔 2011	中国湖南	2007	多科室	痰液、分泌物、血液、胸水	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2006	ATCC 27853	42	6（14）	13（31）	15（36）	8（19）
杜艳 2011	中国云南	2011	多科室	—	梅里埃鉴定系统	药物敏感性卡	CLSI 2008	ATCC 27853	111	69（62）	12（11）	8（7）	22（20）
Moradian 2012	伊朗	2011至2012	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2006	—	54	17（31）	13（24）	3（6）	21（39）
李春红 2012	中国山东	2008至2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、引流液、肺泡灌洗液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	56	17（30）	2（4）	26（46）	11（20）
孙静静 2012	中国广东	2010	多科室	痰液、尿液、分泌物、血液	BD Phoenix 鉴定系统	纸片扩散法	—	ATCC 27853 ATCC 25922	234	36（15）	11（5）	82（35）	105（45）
王玉巧 2012	中国宁夏	2009	门诊	—	MicroScan Walkway鉴定系统	琼脂对倍稀释法	CLSI 2005	—	57	4（7）	4（7）	26（46）	23（40）
Nikokar 2012	伊朗	2010至2011	烧伤科	伤口分泌物	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2008	ATCC 27853	39	16（41）	8（21）	11（28）	4（10）
毕嘉琦 2013	中国广东	2008至2012	多科室	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2010	ATCC 27853	348	67（19）	45（13）	105（30）	131（38）
Rajabnia 2013	伊朗	2008至2009	重症监护病房	仪器设备	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2011	—	81	15（19）	1（1）	15（19）	50（62）
黄娟 2013	中国广东	2011至2012	—	—	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 27853	81	15（19）	1（0）	15（19）	50（62）
朱桂芳 2013	中国江苏	2011	—	痰液、尿液、血液	梅里埃鉴定系统	纸片扩散法	CLSI 2011	ATCC 25922 ATCC 25923	60	2（3）	1（2）	19（32）	38（63）
苏维奇 2013	中国山东	2009至2011	—	—	MicroScan Walkway鉴定系统	NC31试验板	—	ATCC 27853	200	98（49）	22（11）	17（8）	63（32）
Kiddee 2013	泰国	2007至2008	—	痰液、脓液、尿液、血液、伤口分泌物等	手工鉴定	琼脂平皿稀释法	CLSI 2007	—	50	37（74）	9（18）	4（8）	0（0）
Garza 2015	墨西哥	2004至2011	—	—	—	琼脂平皿稀释法	CLSI 2012	ATCC	45	38（84）	5（11）	2（4）	0（0）
多丽波 2015	中国黑龙江	2011至2012	—	痰液、尿液、分泌物、血液	MicroScan Walkway鉴定系统	组合纸片法	—	—	62	16（26）	24（39）	5（8）	17（27）

组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）	组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）
研究地区					样本采集时间
国外	8	4.31	1.65~11.24	77	2005年前	4	10.74	2.25~51.16	87
国内	16	5.13	2.41~10.91	85	2005年后	20	4.01	2.09~7.70	83
样本采集科室					细菌鉴定方法
重症监护病房	4	3.90	1.48~10.26	43	仪器	18	4.65	2.43~8.89	85
其他	20	4.95	2.54~9.64	85	手工	5	5.5	1.22~24.78	81
样本来源					药物敏感性试验
仪器设备	2	6.99	2.45~19.95	0	琼脂平皿稀释法	10	5.83	1.61~21.09	87
人体相关	22	4.67	2.48~8.77	85	纸片法	8	3.06	1.31~7.14	74
样本量					药物敏感性卡	5	7.21	2.52~20.67	81
>100株	6	7.18	2.92~17.69	89	质控菌株
<100株	18	4.03	1.76~9.22	80	无	10	3.79	1.65~8.72	75
					有	14	5.75	2.49~13.28	87

组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）	组别	研究数	OR值	95%CI	I²（%）
研究地区					样本采集时间
国外	8	4.31	1.65~11.24	77	2005年前	4	10.74	2.25~51.16	87
国内	16	5.13	2.41~10.91	85	2005年后	20	4.01	2.09~7.70	83
样本采集科室					细菌鉴定方法
重症监护病房	4	3.90	1.48~10.26	43	仪器	18	4.65	2.43~8.89	85
其他	20	4.95	2.54~9.64	85	手工	5	5.5	1.22~24.78	81
样本来源					药物敏感性试验
仪器设备	2	6.99	2.45~19.95	0	琼脂平皿稀释法	10	5.83	1.61~21.09	87
人体相关	22	4.67	2.48~8.77	85	纸片法	8	3.06	1.31~7.14	74
样本量					药物敏感性卡	5	7.21	2.52~20.67	81
>100株	6	7.18	2.92~17.69	89	质控菌株
<100株	18	4.03	1.76~9.22	80	无	10	3.79	1.65~8.72	75
					有	14	5.75	2.49~13.28	87

[1]	Yueyang Hospital of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine of Shanghai University of Traditional Chinese Medicine Shanghai Center for Clinical Laboratory, Clinical Laboratory Society of Chinese Association for Rehabilitation Medicine Clinical Laboratory Society of Chinese Association of Integrative Medicine, Tumor Immunology Branch of Shanghai Society for Immunology Molecular Diagnostics Society of Shanghai Medical Association. Expert consensus on non-invasive laboratory diagnosis for hepatic fibrosis [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(7): 625-641.
[2]	XIA Yuanzhi, YIN Xiangfei, LIN Sien, LIANG Xiaoliang. Prenatal diagnosis value of BoBs technique assay for chromosomal aneuploidy abnormality：a meta analysis [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(5): 477-483.
[3]	ZHANG Guoying, LU Zhongkui, WANG Yuling, XIA Xia, MENG Ke, HE Fang, HUANG Zihui, YANG Zengmin, LIU Xin. Application of gamma-interferon inducible protein-10 mRNA determination technology in diagnosis of extrapulmonary tuberculosis [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(4): 372-376.
[4]	WENG Wenhao. Research progress in laboratory diagnosis and immune regulatory mechanisms of pediatric autoimmune diseases [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(3): 205-208.
[5]	MA Zhan, WENG Wenhao. Autoimmune liver disease in children and progress of laboratory diagnosis [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(3): 218-222.
[6]	YU Jiajie, ZHANG Zhizhi, LUO Qingqiong, KE Xing. Predicting early colorectal tumor risk using a deep learning model based on multiple serum tumor markers [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(3): 253-258.
[7]	WANG Binbin, LI Fengqi, GUO Fenglian, ZHANG Rui, KANG Huihui, WANG Yuetong. Clinical characteristic and genetic analysis of a new mutation of SF3B4 gene causing neonatal acrofacial dysostosis 1，Nager type [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(2): 142-147.
[8]	WANG Chengyun, GU Ping, PAN Qiuhui, WANG Jing. Changes and clinical value of blood coagulation indexes in children with infection [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(2): 178-181.
[9]	SHI Jian, LEI Jing, GENG Yan. Application role of metagenomic next-generation sequencing in diagnosis of pulmonary infections [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(12): 1232-1236.
[10]	XU Ben, FENG Zhangliang, SONG Xiaojun, JIN Dazhi, CHEN Yu. Research progress in molecular diagnostic techniques for respiratory tract infections [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(10): 1019-1024.
[11]	LUO Jing, YUAN Jiayi, YAO Xiaoyan, FAN Lieying. Changes in cathepsin C expression in peripheral blood monocyte subsets of RA patients [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(10): 933-940.
[12]	DING Jing, LI Huidan, ZHANG Chunling, WANG Xiaorui, LIU Weiling, LIN Lihui, QIU Huiying. Analysis of laboratory diagnosis and prognostic factors of myeloid neoplasms based on different classification criteria [J]. Laboratory Medicine, 2025, 40(1): 25-31.
[13]	JIN Chunlei, HU Hui, LIU Jiao, YANG Mufeng, SHAN Qunda, CHEN Penglong. Application role of single nucleotide polymorphism microarray analysis in pregnant women with different prenatal diagnostic indications [J]. Laboratory Medicine, 2024, 39(9): 841-846.
[14]	DING Jing, ZHANG Chunling, WANG Xiaorui, LI Huidan, WANG Hongling, LIU Weiling, LIN Lihui, LI Li. Laboratory diagnosis and prognostic factor analysis of core binding factor-related acute myeloid leukemia [J]. Laboratory Medicine, 2024, 39(7): 673-681.
[15]	WANG Tiankai, LIU Lin, JIN Peipei, WANG Fang, DING Ning. Clinical value of new neutrophil parameter NEU-X，NEU-Y and NEU-Z in diagnosis of sepsis [J]. Laboratory Medicine, 2024, 39(7): 682-686.