Results of non-invasive prenatal testing-plus in 5 696 pregnant women

doi:10.3969/j.issn.1673-8640.2023.06.009

Abstract

Abstract:

Objective To investigate the value of non-invasive prenatal testing-plus（NIPT-plus） in prenatal screening. Methods The results of NIPT-plus，interventional prenatal diagnosis and follow-up outcome in 5 696 pregnant women in Maternal and Child Health Hospital of Jiaozuo from December 2019 to June 2021 were analyzed to study the status of NIPT-plus on detecting chromosome aneuploidy and copy number variation（CNV）. Results Totally，5 685 cases were determined among the 5 696 pregnant women，and the determination rate of high-risk in chromosomal abnormality was 2.60%（148/5 685） by NIPT-plus. NIPT-plus had higher positive predictive values on 21-trisomy and 18-trisomy（65.22% and 66.67%） than sex chromosome abnormality high-risk（25.00%）and chromosome microdeletions/microduplications（26.83%）. The consistency rates of the results of microdeletions and microduplications in NIPT-plus and prenatal diagnosis were 43.75%（7/16）and 40.00%（10/25），respectively. The rate of pregnancy termination in microdeletion pregnant women was higher than that in microduplication pregnant women. Conclusions NIPT-plus has high positive predictive value in screening 21-trisomy and 18-trisomy. There is a low positive predictive value for sex chromosome abnormality and CNV by NIPT-plus. It is necessary to combine the results of interventional prenatal diagnosis. When necessary，CNV diagnosed by prenatal diagnosis should verify the source in order to provide correct genetic counseling for pregnant women.

Key words: Non-invasive prenatal testing-plus, Prenatal screening, Chromosome, Copy number variation, Prenatal diagnosis

CLC Number:

R446.1

ZHANG Chu, WANG Jianhong, LI Rui, XIAO Yanhua, WANG Heng, ZHANG Pinxiao, XU Ningxin, XIA Banban. Results of non-invasive prenatal testing-plus in 5 696 pregnant women[J]. Laboratory Medicine, 2023, 38(6): 553-558.

Figures/Tables 5

References 18

[1]	柯柳华, 张红雨, 付莹莹, 等. 产前筛查与产前诊断检测技术研究进展[J]. 中国产前诊断杂志(电子版), 2018, 10(1):51-54.
[2]	LO Y M, CORBETTA N, CHAMBERLAIN P F, et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum[J]. Lancet, 1997, 350(9076):485-487. DOI PMID
[3]	国家卫生计生委办公厅关于规范有序开展孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断工作的通知[J]. 中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会公报, 2016, 159(10):52-68.
[4]	SHAW J, SCOTCHMAN E, CHANDLER N, et al. Preimplantation genetic testing:non-invasive prenatal testing for aneuploidy,copy-number variants and single-gene disorders[J]. Reproduction, 2020, 160(5):A1-A11. DOI URL
[5]	MCGOWAN-JORDAN J, SIMONS A, SCHMID M. ISCN 2016:an international system for human cytogenomic nomenclature (2016)[M]. Basel:S. Karger AG, 2016.
[6]	GEPPERT J, STINTON C, JOHNSON S, et al. Antenatal screening for fetal trisomies using microarray-based cell-free DNA testing:a systematic review and meta-analysis[J]. Prenat Diagn, 2020, 40(4):454-462. DOI URL
[7]	陈艺升, 王菲菲, 陆娄恺奕, 等. 扩展性无创产前检测对高风险胎儿的应用分析[J]. 中华预防医学杂志, 2021, 55(12):1491-1495.
[8]	赵干业, 代鹏, 郜珊珊, 等. 无创产前检测在14 279例单胎染色体异常筛查中的应用[J]. 中华医学遗传学杂志, 2021, 38(7):702-704.
[9]	CHEN Y, YU Q, MAO X, et al. Noninvasive prenatal testing for chromosome aneuploidies and subchromosomal microdeletions/microduplications in a cohort of 42 910 single pregnancies with different clinical features[J]. Hum Genomics, 2019, 13(1):60. DOI
[10]	卢寨娥, 田丽蕴, 应红军, 等. 14 047例高龄孕妇无创产前检测的结果分析[J]. 中华医学遗传学杂志, 2020, 37(6):613-616.
[11]	刘宁, 郭煜, 朱朝锋, 等. 18-三体综合征无创产前筛查假阴性一例[J]. 中华围产医学杂志, 2019, 22(11):808-811.
[12]	王东梅, 杨洁霞, 彭海山, 等. 40 628例无创产前胎儿21、18、13号染色体筛查结果的分析[J]. 中华医学遗传学杂志, 2021, 38(11):1045-1050.
[13]	BOUCHLARIOTOU S, TSIKOURAS P, DIMITRAKI M, et al. Turner's syndrome and pregnancy:has the 45,X/47,XXX mosaicism a different prognosis? Own clinical experience and literature review[J]. J Matern Fetal Neonatal Med, 2011, 24(5):668-672. DOI URL
[14]	LEGGETT V, JACOBS P, NATION K, et al. Neurocognitive outcomes of individuals with a sex chromosome trisomy:XXX,XYY,or XXY:a systematic review[J]. Dev Med Child Neurol, 2010, 52(2):119-129. DOI URL
[15]	HU H, WANG L, WU J, et al. Noninvasive prenatal testing for chromosome aneuploidies and subchromosomal microdeletions/microduplications in a cohort of 8 141 single pregnancies[J]. Hum Genomics, 2019, 13(1):14. DOI
[16]	LI R, WAN J, ZHANG Y, et al. Detection of fetal copy number variants by non-invasive prenatal testing for common aneuploidies[J]. Ultrasound Obstet Gynecol, 2016, 47(1):53-57. DOI PMID
[17]	STEFANSSON H, RUJESCU D, CICHON S, et al. Large recurrent microdeletions associated with schizophrenia[J]. Nature, 2008, 455(7210):232-236. DOI
[18]	BENN P, CHAPMAN A R. Ethical and practical challenges in providing noninvasive prenatal testing for chromosome abnormalities:an update[J]. Curr Opin Obstet Gynecol, 2016, 28(2):119-124.

送检指征	例数	21-三体综合征高风险/例	18-三体综合征高风险/例	13-三体综合征高风险/例	性染色体异常高风险/例	CNV		NIPT-plus高风险/ [例（%）]	确诊/例	阳性预测值/ [%（例/例）]
送检指征	例数	21-三体综合征高风险/例	18-三体综合征高风险/例	13-三体综合征高风险/例	性染色体异常高风险/例	微缺失/例	微重复/例	NIPT-plus高风险/ [例（%）]	确诊/例	阳性预测值/ [%（例/例）]
唐氏筛查临界风险	2 572	4	1	3	15	13	24	60（2.33）	5	8.33（5/60）
单纯高龄	1 299	8	1	0	10	4	5	28（2.16）	10	35.71（10/28）
唐氏筛查高风险	397	8	0	0	6	0	4	18（4.53）	10	55.56（10/18）
NT增厚	50	0	0	0	0	0	2	2（4.00）	0	0.00（0/2）
其他	1 367	3	1	0	14	8	14	40（2.93）	11	27.50（11/40）
合计	5 685	23	3	3	45	25	49	148（2.60）	36	24.32（36/148）

送检指征	例数	21-三体综合征高风险/例	18-三体综合征高风险/例	13-三体综合征高风险/例	性染色体异常高风险/例	CNV		NIPT-plus高风险/ [例（%）]	确诊/例	阳性预测值/ [%（例/例）]
送检指征	例数	21-三体综合征高风险/例	18-三体综合征高风险/例	13-三体综合征高风险/例	性染色体异常高风险/例	微缺失/例	微重复/例	NIPT-plus高风险/ [例（%）]	确诊/例	阳性预测值/ [%（例/例）]
唐氏筛查临界风险	2 572	4	1	3	15	13	24	60（2.33）	5	8.33（5/60）
单纯高龄	1 299	8	1	0	10	4	5	28（2.16）	10	35.71（10/28）
唐氏筛查高风险	397	8	0	0	6	0	4	18（4.53）	10	55.56（10/18）
NT增厚	50	0	0	0	0	0	2	2（4.00）	0	0.00（0/2）
其他	1 367	3	1	0	14	8	14	40（2.93）	11	27.50（11/40）
合计	5 685	23	3	3	45	25	49	148（2.60）	36	24.32（36/148）

NIPT-plus结果	例数	介入性产前诊断		阳性预测值/ [%（例/例）]	NIPT-plus假阴性/例	NIPT-plus假阳性率/[%（例/例）]	确诊孕妇终止妊娠率/[%（例/例）]
NIPT-plus结果	例数	例数/例	确诊数/例	阳性预测值/ [%（例/例）]	NIPT-plus假阴性/例	NIPT-plus假阳性率/[%（例/例）]	确诊孕妇终止妊娠率/[%（例/例）]
21-三体综合征高风险	23	23	15	65.22（15/23）	0	0.14（8/5 670）	100.00（15/15）
18-三体综合征高风险	3	3	2	66.67（2/3）	1	0.02（1/5 683）	100.00（2/2）
13-三体综合征高风险	3	3	0	0.00（0/3）	0	0.05（3/5 685）	0.00（0/0）
性染色体异常高风险	45	32	8	25.00（8/32）			87.50（7/8）
微缺失/微重复	74	41	17	41.46（17/41）			25.53（4/17）

NIPT-plus结果	例数	介入性产前诊断		阳性预测值/ [%（例/例）]	NIPT-plus假阴性/例	NIPT-plus假阳性率/[%（例/例）]	确诊孕妇终止妊娠率/[%（例/例）]
NIPT-plus结果	例数	例数/例	确诊数/例	阳性预测值/ [%（例/例）]	NIPT-plus假阴性/例	NIPT-plus假阳性率/[%（例/例）]	确诊孕妇终止妊娠率/[%（例/例）]
21-三体综合征高风险	23	23	15	65.22（15/23）	0	0.14（8/5 670）	100.00（15/15）
18-三体综合征高风险	3	3	2	66.67（2/3）	1	0.02（1/5 683）	100.00（2/2）
13-三体综合征高风险	3	3	0	0.00（0/3）	0	0.05（3/5 685）	0.00（0/0）
性染色体异常高风险	45	32	8	25.00（8/32）			87.50（7/8）
微缺失/微重复	74	41	17	41.46（17/41）			25.53（4/17）

CNV结果	染色体位置	片段大小/Mb	来源	超声结果	母亲临床表型	是否终止妊娠
微缺失
孕妇1	18q21.2q23 Chr18：52320001_78020000	25.70	未知	NT正常，中晚孕正常	无随访	是
孕妇2	4q34.3q35.2 Chr4：183180000_190940000	7.76	未知	胎儿晶状体回声高，考虑白内障	无随访	是
孕妇3	16p13.11p12.3 Chr16：15480000_18180000	2.70	母亲	NT正常，中晚孕正常	无异常	否
孕妇4	10q11.22q11.23 Chr10：46960000_51800000	4.84	母亲	NT正常，中晚孕正常	无异常	否
微重复
孕妇5	22q11.21 Chr22：18880000_21480000	2.60	母亲	NT正常，中晚孕正常	无异常	否
孕妇6	1q21.1q21.2 Chr1：144000000_147780000	3.78	母亲	中晚孕脐绕颈1周，新生儿卵圆孔未闭，心房水平左向右分流，早产儿脑	无异常	否