原发性肝癌组织及细胞系中DNMT mRNA表达的检测及意义
高波, 李海平, 余宗涛, 吕军, 张吉才
湖北医药学院附属太和医院检验科,湖北 十堰 442000

作者简介:高 波,男,1981年生,硕士,主管技师,主要从事分子生物学检验工作。

通讯作者:张吉才,联系电话:0719-8801063。

摘要
目的

检测原发性肝癌组织及细胞系Hep3B、 HepG2中甲基化转移酶(DNMT)mRNA的表达,分析乙型肝炎病毒(HBV)感染与DNMT mRNA表达之间的关系。

方法

应用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测44例原发性肝癌组织及2种肝癌细胞系中DNMT1、DNMT2、DNMT3ADNMT3BGAPDH基因mRNA表达水平。

结果

32例血清HBV标志物阳性患者肝癌组织中DNMT1、DNMT3ADNMT3B mRNA表达水平明显高于12例血清HBV标志物阴性患者肝癌组织(P<0.05)。DNMT1、DNMT2、DNMT3ADNMT3B mRNA在HBV相关细胞系Hep3B中相对表达分别为1.26±0.15、0.76±0.15、1.26±0.20、0.66±0.13,在非HBV相关肝癌细胞系HepG2中的相对表达分别为0.64±0.11、0.62±0.12、0.48±0.12、0.36±0.10,Hep3B细胞系中DNMT1、DNMT3ADNMT3B mRNA表达高于HepG2细胞系(P<0.01)。

结论

HBV相关原发性肝癌组织和肝癌细胞系中存在DNMT mRNA表达增高; HBV感染可能刺激DNMT mRNA的表达,进而促进抑癌基因的甲基化。

关键词: 甲基化转移酶; 乙型肝炎病毒; 荧光定量聚合酶链反应; 表达
中图分类号:Q503 文献标志码:A 文章编号:1673-8640(2013)08-0716-04
Determination and its significance of DNMT mRNA expression in Hep3B,HepG2 and hepatocellular cancer tissues
GAO Bo, LI Haiping, YU Zongtao, L#cod#x000dc; Jun, ZHANG Jicai
Department of Clinical Laboratory,Taihe Hospital,Hubei University of Medicine, Hubei Shiyan 442000, China
Abstract
Objective

To investigate the expression of DNA methyltransferase(DNMT) mRNA in Hep3B, HepG2 and hepatocellular cancer tissues,and to analyze the relationship between hepatitis B virus(HBV) infection and DNMT mRNA expression.

Methods

Fluorescence quantitative polymerase chain reaction (PCR) was used to determine the mRNA expressions ofDNMT1,DNMT2,DNMT3A,DNMT3B mRNA andGAPDH genes in Hep3B, HepG2 and hepatocellular cancer tissues.

Results

In HBV-associated cancerous tissues,the mRNA expression levels ofDNMT1,DNMT 3A andDNMT 3B mRNA were higher than those in non-HBV-associated cancerous tissues (P<0.05). The expressions ofDNMT1,DNMT2,DNMT3A andDNMT3B mRNA were 1.26±0.15, 0.76±0.15, 1.26±0.20 and 0.66±0.13 in Hep3B and 0.64±0.11, 0.62±0.12, 0.48±0.12 and 0.36±0.10 in HepG2. The expressions ofDNMT1,DNMT3A andDNMT3B mRNA in Hep3B were higher than those in HepG2(P<0.01).

Conclusions

Overexpression of DNMT mRNA is detected in HBV-associated Hep3B, HepG2 and hepatocellular cancer tissues. The HBV infection can stimulate the expression of DNMT mRNA,and involve the methylation of tumor-suppressor genes.

Keyword: DNA methyltransferase; Hepatitis B vivus; Fluorescence quantitative polymerase chain reaction; Expression
引言

我们既往的研究发现原发性肝癌组织中 p16基因发生甲基化的频率非常高,并且通过分组发现乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染相关肝癌的 p16基因甲基化的频率要高于非HBV相关肝癌,提示HBV的持续感染对 p16基因的异常甲基化有一定作用,但其作用机制尚不明确[ 1, 2, 3]。基因的异常甲基化可能与多种因素有关,包括甲基化转移酶(DNA methyltransferase,DNMT) 水平、致癌物接触、基因修复缺陷等,其中DNMT是调节甲基化的主要因素。为了解HBV感染与DNMT表达之间的关系,本研究采用荧光定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)检测44例原发性肝癌组织和HBV相关肝癌细胞系Hep3B、非HBV相关肝癌细胞系HepG2中4种DNMT mRNA(DNMT1、DNMT2、DNMT3A、DNMT3B)的表达情况,初步探讨DNMT mRNA表达改变与HBV感染及肝癌等的关系。

材料和方法
一、临床资料

收集太和医院2010年12月1日至2012年2月1日的肝癌患者术后新鲜癌组织标本44例,患者男35例,女9例。所有组织标本均经病理学确诊,临床资料完整。组织标本收集后液氮中保存备用。根据患者血清中HBV标志物的存在与否,将癌组织分为2组。HBV相关性肝癌组:共32例,患者血液标本中至少检测出一种HBV感染的标志物,HBsAg、HBeAg、抗HBe、抗HBc或HBV DNA;非HBV相关性肝癌组:血液标本中未检测出任何一种HBV感染标志物,共12例。

二、细胞及主要仪器试剂

肝癌细胞系Hep3B和HepG2购于中国科学院典型培养物保藏委员会细胞库,来自于美国标准生物品收藏中心;细胞培养基DMEM、小牛血清均购于GIBCO公司;Trizol Reagent(Invitrogen公司);逆转录试剂盒(Promege公司);PCR试剂(上海生工公司);PCR仪PE7500(ABI公司);SYBR GreenⅠ染料(Gene公司);G-BOX紫外凝胶成像系统(Gene公司);ND-2000微量核酸定量仪(美国NanoDrop公司);150 bp DNA mark(上海生工公司);DNA mark(北京天根公司);TG-16WS台式高速冷冻离心机(日立公司)。

三、方法

1. PCR引物设计与合成

DNMT1:5'-CGACTACATCAAAGGCAGCAACCTG-3',5'-TGGAGTGGACTTGTGGGTGTTCTC-3',扩增产物166 bp;DNMT2:5'-AAGCTGTAAGCCAGCCCATATAC-3',5'-TCAGCAGTGAACAGAACCTACATG-3',扩增产物148 bp;DNMT3A:5'-CGAGTCCAACCCTGTGATGATTG-3',5'-GCTGGTCTTTGCCCTGCTTTATG-3',扩增产物221 bp;DNMT3B:5'-TTGGAATAGGGGACCTCGTGTG-3',5'-AGAGACCTCGGAGAACTTGCCATC-3',扩增产物152 bp;GAPDH:5'-GAAGGTGAAGTCGGAGTC-3',5'-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3',扩增产物226 bp。所有引物合成由北京赛百盛公司完成。

2. 细胞培养

人肝癌细胞株HepG2(HBsAg阴性)和Hep3B(HBV阳性)待复苏后培养于含100 mL/L小牛血清、100 kU/L青霉素、100 mg/L链霉素的 DMEM培养液,培养在6孔培养板中,置于5%CO2的37 ℃的细胞培养箱,每3~4天消化传代1次。培养结束时,先把培养液抽干,加入3 mL 0.05%胰蛋白酶-乙二胺四乙酸消化细胞,置于37 ℃ 2 min后收集细胞,再以磷酸盐缓冲液洗涤细胞备用。

3. 癌组织及细胞总RNA提取

参照Trizol说明书提取细胞中总RNA。

4. 逆转录

参照试剂盒说明书将总RNA逆转录为cDNA。

5. PCR扩增

按试剂盒要求操作。反应条件:95 ℃ 预变性3 min;95 ℃ 30 s,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,共40个循环;最后一循环于72 ℃ 5 min。

6. 结果判断

基因相对定量方法:利用检测得到的Ct 值和计算得到的扩增效率,以参比基因( GAPDH)为内参,计算mRNA的相对表达量。 R=Test mRNA/参比mRNA=(1 + E参比)Ct(参比) / (1 + Etest)Ct(test)

四、统计学方法

应用SPSS13.0统计软件进行结果分析,计量资料经检验符合正态分布的,采用 ±s表示,采用两独立样本 t检验,以双侧 P<0.05为差异有统计学意义。

结果
一、DNMT mRNA 实时荧光定量PCR的建立

2种肝癌细胞系重复5次培养,收集细胞后提取总RNA,待浓度和纯度符合要求后进行逆转录及PCR扩增,最后进行各个基因表达检测,基因表达的结果用 ±s表示。检测4种DNMT mRNA 实时荧光定量PCR均具有比较好的特异性,熔点曲线见图1:

图1 DNMT和GAPDH的熔点曲线

二、4种DNMT mRNA在肝癌细胞系Hep3B与HepG2中的表达

Hep3B细胞系中DNMT1、DNMT3A、DNMT3B mRNA表达高于HepG2细胞系( P<0.01)。见表1:

表1 2株肝癌细胞系中DNMT mRNA的表达(R)
三、原发性肝癌患者肝癌组织DNMT mRNA表达的分析

HBV感染相关癌组织中DNMT1、DNMT3A和DNMT3B mRNA表达水平明显高于非HBV感染相关癌组织( P<0.05)。见表2:

表2 肝癌组织中DNMT mRNA的表达分析
讨论

至今发现的DNMT至少有4种亚型,分别为:DNMT1、DNMT2、DNMT3A和DNMT3B,主要功能是维持甲基化和全程甲基化。甲基化是在DNMT的催化作用下加到C上形成mC[ 4],从理论上讲应与DNMT的结构和/或活性异常有关。DNMT1的主要功能是保证新合成的DNA具有高度的保真性,并且维持甲基化转移酶的功能[ 5]。DNMT2的作用目前尚不明确,可能与着丝粒区域的甲基化控制有关。DNMT3A和DNMT3B在原始胚胎形成中起重要的作用,主要功能是催化DNA甲基化的新生位点。正常细胞DNMT1的过度表达可导致CpG岛超甲基化,促进细胞转化。有研究表明,部分肿瘤细胞的DNMT水平表达明显高于正常细胞,并且与某些抑癌基因的超甲基化状态相关[ 6]。在细胞周期中不同的DNMT mRNA可能受不同的调节机制调控,异常的DNMT表达可引起甲基化改变,且DNMT功能改变可引起异常甲基化或正常甲基化模式的丢失,导致DNA甲基化模式的转换。与DNMT相关的因素可能有:(1)与DNMT1忠诚性有关;(2)与DNMT3A和DNMT3B的错误靶向有关;(3)与错误的甲基化修复机制有关;(4)与DNMT的活性异常有关;(5)与染色质构型重塑(chromatin remodeling)有关。

HBV感染与肝癌之间的关系十分密切,流行病学调查发现肝癌患者HBsAg阳性率可达90%[ 7]。国内外的研究也表明持续的HBV感染所导致的部分抑癌基因甲基化是肝癌发生、发展过程中的早期事件[ 3, 8, 9]。虽然持续的HBV感染可以导致部分抑癌基因的甲基化发生,但是这其中的机制尚不明确。本研究采用定量PCR检测HBV相关性与非HBV相关性肝癌细胞系中4种DNMT mRNA表达水平的变化,探讨HBV感染是否对一种或多种DNMT mRNA的表达水平产生影响。

在本结果中发现HBV感染肝癌组织和非HBV感染肝癌组织间DNMT mRNA表达水平不同。HBV感染相关肝癌组织中DNMT1、DNMT3A和DNMT3B mRNA水平明显高于非HBV感染相关癌组织,还发现可分泌HBsAg的Hep3B细胞这3种DNMT mRNA表达也高于HBsAg阴性的HepG2细胞。上述试验结果表明HBV的病毒组分可以剌激受染细胞DNMT mRNA的表达,进而促进抑癌基因的甲基化。甲基化酶的表达异常改变可能与基因异常甲基化和肿瘤形成有关,在多种肿瘤中均可见DNMT mRNA的过度表达。国内许军等[ 10]在研究人肝癌细胞株、人正常肝细胞株及癌旁细胞株中DNMT3B的表达发现,肝癌细胞株中DNMT3B mRNA的表达要明显高于正常和癌旁细胞株,提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生相关。

病毒感染与DNMT之间的这种关系并不只存在于肝癌细胞中。有研究表明除HBV外的其他病毒及其组分也可通过激活DNMT的活性从而进一步使抑癌基因的表达下降。Tsai等[ 11]在培养的鼻咽癌细胞系中发现,经过EB病毒感染的癌基因产物(LMP-1)能够诱导DNMT1、DNMT3A、DNMT3B的表达,进而使 E-cadherin基因发生甲基化。EB病毒是胃癌发生的一个潜在危险因子,研究发现,在胃癌发生过程中,DNMT1的高表达与h-MLH、thrombospondin-1、E-cadherin等基因启动子甲基化和CpG岛甲基化表型相关,并且这些基因的甲基化均与EB病毒感染有关[ 12]。HB病毒感染、DNMT活性改变、基因甲基化都是肝癌形成的早期事件,那么从某种程度上讲,三者具有潜在的关联,HBV感染作为肝癌形成的一个外部生物因子,可能通过刺激 DNMT基因的表达,进而促进抑癌基因甲基化而参与肝癌形成,这也为了解肝癌的发生机制提供了一个新的思路。

The authors have declared that no competing interests exist.

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